PhD-Stelle in Statistischem Maschinellen Lernen für selbstfahrende Mikroskopie 100%
Universität Bern
Bern
Auf einen Blick
- Veröffentlicht:18 Dezember 2025
- Pensum:100%
- Arbeitsort:Bern
Job-Zusammenfassung
Das Pertz Lab und die Ginsbourger Group suchen eine*n motivierte*n PhD-Student*in. Hier erwartet dich ein innovatives Umfeld mit spannenden Herausforderungen.
Aufgaben
- Du arbeitest an einem interdisziplinären Projekt zwischen Biologie und Statistik.
- Entwicklung autonomer Mikroskope zur Analyse biologischer Dynamiken.
- Du lernst, mathematische Modelle in Echtzeit anzuwenden.
Fähigkeiten
- Ein Masterabschluss in Mathematik, Statistik oder Informatik ist erforderlich.
- Erfahrungen in statistischer Modellierung und Programmierung sind von Vorteil.
- Neugier für biologische Systeme, Vorkenntnisse im Labor sind nicht nötig.
Ist das hilfreich?
Gemeinsame Stelle – Pertz Lab ( Institut für Zellbiologie ) & Ginsbourger Gruppe ( Institut für Mathematische Statistik & Versicherungswissenschaft )
Wir suchen eine hochmotivierte Doktorandin / einen hochmotivierten Doktoranden für ein vollständig kollaboratives Promotionsprojekt an der Schnittstelle von maschinellem Lernen, Statistik und Lebendzellbiologie.
Die Stelle wird gemeinsam von Prof. Olivier Pertz (Zellbiologie) und Prof. David Ginsbourger (Statistik) betreut, und die Doktorandin / der Doktorand wird gleichermaßen in beiden Forschungsumgebungen eingebunden sein.
Ihr Umfeld
Sie werden Teil von zwei sich ergänzenden Forschungsgemeinschaften sein:
Pertz Lab – Institut für Zellbiologie (ICB)
Eine führende Gruppe, die Echtzeitsteuerung der zellulären Signaldynamik mittels Mikroskopie, quantitativer Bildgebung und Optogenetik vorantreibt. Interdisziplinäres Team mit engen Verbindungen zu Ingenieurwesen und Datenwissenschaft.
Ginsbourger Gruppe – Institut für Mathematische Statistik und Versicherungswissenschaft (IMSV)
International anerkannt in Gaußprozessmodellierung, Bayesschem optimalem Design und maschinellem Lernen für wissenschaftliche Entdeckungen. Starke Kooperationen in Mathematik, ML und angewandten Wissenschaften.
Sie werden regelmäßig zwischen beiden Laboren wechseln und fließend in der disziplinübergreifenden Kommunikation werden – ein großer Karriervorteil.
Projektübersicht
Zellen nehmen dynamische Reize wahr, integrieren sie und reagieren darauf über komplexe Signalnetzwerke. Das Pertz Lab hat leistungsstarke optogenetische Werkzeuge und fluoreszierende Biosensoren entwickelt, die eine direkte Störung und Messung dieser Netzwerke mittels Licht ermöglichen. Gemeinsam mit der Ginsbourger Gruppe wollen wir autonome „selbstfahrende“ Mikroskope schaffen, die:
- statistische Modelle biologischer Dynamiken in Echtzeit erstellen
- das informativste nächste Experiment vorhersagen
- dies automatisch an lebenden Zellen ausführen
Wichtige Methoden umfassen:
- Gaußprozesse (heteroskedastisch & multivariat)
- Operatorwertige und tiefe Kernel
- Aktives Bayessches experimentelles Design
- Physik-informierte neuronale Netze
- Closed-Loop-Steuerung biologischer Systeme
Dieses Projekt bietet eine seltene Gelegenheit, mathematische Modelle lebendig werden zu sehen, die Experimente in Echtzeit steuern.
Lehre: Die Stelle beinhaltet eine kleine Lehrverpflichtung in Statistik → beinhaltet ein erhöhtes Gehalt im Vergleich zur Standard-Promotionfinanzierung in der Schweiz.
Warum Bern wählen?
- Top-bewertete Schweizer Forschungsuniversität
- Internationale Gemeinschaft, hohe Lebensqualität
- Einfacher Zugang zu Europa
- Hervorragende Unterstützung für Nachwuchswissenschaftler
Ihr Profil
- Masterabschluss in Mathematik, Statistik, Informatik, Ingenieurwesen
- Solide Kenntnisse in statistischer Modellierung & Wahrscheinlichkeitstheorie
- Erfahrung im Programmieren (Python, R, Julia, Matlab...)
- Motivation zur engen Zusammenarbeit mit experimentellen Forschern
- Neugier auf biologische Systeme – keine vorherige Nasslaborerfahrung erforderlich!
Bewerbung
Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung ausschließlich elektronisch in einer einzigen PDF mit folgenden Dokumenten ein:
- kurzes Motivationsschreiben
- Lebenslauf mit Monat/Jahr
- BSc- und MSc-Notenauszüge (in einer der offiziellen Landessprachen der Schweiz oder Englisch)
- Kontaktinformationen von zwei Referenzen
- Alle weiteren relevanten Dokumente
in einer E-Mail an beide Adressen:
olivier.pertz@unibe.ch
david.ginsbourger@unibe.ch
Bewerbungen werden fortlaufend geprüft, bis die Stelle besetzt ist.
