Postdoktorandenstelle - DeepMarrow kollaboratives TANDEM-Projekt

Einführung

Postdoktorandenstelle – DeepMarrow kollaboratives TANDEM-Projekt @Labor für Regenerative Hämatopoese (GR-NAVEIRAS)

Ein neu finanziertes ISREC Foundation TANDEM-Projekt sucht eine hochmotivierte Postdoktorandin oder einen Postdoktoranden, um Kliniker, Ingenieure und computergestützte Biologen zusammenzubringen, um einen auf künstlicher Intelligenz basierenden digitalen Histopathologie-Workflow namens DeepMarrow zu entwickeln, zu trainieren und anzuwenden, der zur Ergebnisstratifizierung bei akuter myeloischer Leukämie (AML) beiträgt. Das Team hat seinen Sitz in Lausanne, Schweiz, und umfasst drei Institutionen: (i) die Universität Lausanne (UNIL) Fakultät für Biologie und Medizin, eine führende öffentliche Hochschuleinrichtung und Forschungseinrichtung in der Schweiz, (ii) das Universitätsspital Lausanne, das wiederholt als eines der 20 besten akademischen Krankenhäuser der Welt eingestuft wurde, und (iii) die École Polytechnique Fédérale de Lausanne, eine der weltweit renommiertesten Institutionen für Ingenieurwesen, Technologie und Wissenschaft. Die kooperierenden Labore sind Teil des Swiss Cancer Center Leman Netzwerks ( https://sccl.ch/) .

Präsentation

Eine Postdoktorandenstelle ist verfügbar im UNIL-CHUV Labor für Regenerative Hämatopoese, geleitet von Prof. Olaia Naveiras (Abteilung für Biomedizinische Wissenschaften  https://wp.unil.ch/naveiras-lab/team/
und Hämatologie Service Translationale Forschungseinheit https://www.chuv.ch/en/hematologie/hemhome/ Forschung/  und von Dr. Daniel Sage in der EPFL Biomedical Imaging Group ( https://bigwww.epfl.ch/) . Das Projekt konzentriert sich auf die Untersuchung unerforschter morphologischer Merkmale und räumlicher Beziehungen in Knochenmarkgewebeschnitten von Patienten, die sich einer Induktionschemotherapie bei AML unterziehen, mit Benchmarking gegenüber anderen Szenarien intensiver Knochenmarkumbauprozesse. Wichtige Mitwirkende am Projekt sind Prof. Laurence de Leval (Institut für Pathologie, CHUV-UNIL),  Prof. Bart Deplancke (Institut für Bioengineering, EPFL) und Prof. Sabine Blum (Hämatologie Service, CHUV).

Stelleninformationen

Voraussichtliches Eintrittsdatum in die Stelle: 01.03.2026 oder vorbehaltlich der Genehmigung des Arbeitsvisums

Vertragsdauer: 24 Monate (12+12 Monate, mit Möglichkeit eines 3. Jahres)

Beschäftigungsgrad: 80-100%

Arbeitsort: Lausanne, UNIL-FBM (CHUV Bugnon Campus)

Ihre Aufgaben

Wir suchen eine rigorose, kreative und teamorientierte Person mit Leidenschaft und idealerweise bereits umfangreicher Expertise in Bildanalyse und verwandten maschinellen Lernverfahren sowie dem Wunsch nach klinischer Wirkung. Die ausgewählte Kandidatin oder der ausgewählte Kandidat wird (i) eng mit Klinikern zusammenarbeiten, um die longitudinale Knochenmark-Bildkohorte und die codierten klinischen Daten der drei derzeit genehmigten lokalen, nationalen und internationalen Kohorten sicher zu strukturieren, während (ii) der DeepMarrow-Workflow und die morphologische Merkmalsextraktion aus dem verfügbaren Trainingssatz (doi: 10.1016/j.modpat.2022.100088) entwickelt werden und (iii) spezifische Proben für multimodale Entdeckungsanalysen (Multiplex-Immunhistochemie und räumliche Transkriptomik) identifiziert werden. Garantierte tiefgehende Einblicke in maschinelles Lernen, fortgeschrittene Hämatopathologie, multimodale Omics-Analysen einschließlich räumlicher Transkriptomik und Knochenmark-Stroma-Nischenbiologie innerhalb eines hochmotivierten und kollaborativen Teams.

Ihre Qualifikationen

- PhD- oder MD/PhD-Abschluss in computergestützter Biologie oder Pathologie, vorzugsweise in den Bereichen Krebs- oder Stammzellbiologie
- Hohe Autonomie in der computergestützten Analyse, versiert in der Verarbeitung von Bild- und/oder Transkriptomdaten und in der Lage, Projekte zu managen, die Datenkuratierung und Deep-Learning-Workflows integrieren.
- Laborerfahrung in Zellbiologie oder experimenteller Pathologie (z.B. morphologische Gewebebewertung, H&E, Immunhistochemie, Verarbeitung von primärem menschlichem Gewebe) ist ein Muss.
- Erfahrung in der Einholung ethischer Genehmigungen und im Umgang mit humanem Primärgewebe, einschließlich Kenntnis des rechtlichen und ethischen Rahmens (z.B. TRREE-Zertifizierung), wird sehr geschätzt
- Expertise in diagnostischer Hämatopathologie oder experimenteller Hämatologie wird sehr geschätzt
- Nachgewiesene Fähigkeit zum Projektmanagement in einem hochgradig kollaborativen Umfeld ist ein Muss
- Fließende Englischkenntnisse mit hervorragenden mündlichen und schriftlichen Kommunikationsfähigkeiten.

Bevorzugt werden herausragende Kandidaten mit einer soliden Bilanz von peer-reviewten Publikationen und/oder selektiven internationalen Konferenzpräsentationen, die ab März-April 2026 verfügbar sind.

Was die Stelle Ihnen bietet

Ein dynamisches, anregendes, interdisziplinäres Forschungsumfeld, modernste Technologien, hochmoderne Kernanlagen und attraktive Arbeitsbedingungen zusätzlich zu einem faszinierenden Leben in der Schweiz.
Der UNIL/CHUV Medizin-Campus und der EPFL Campus befinden sich in Lausanne, in unmittelbarer Nähe zum Genfersee und den Schweizer Alpen.

Kontakt für weitere Informationen

Prof. Olaia Naveiras und Dr. Daniel Sage
Email (bitte an alle drei): olaia.naveiras@unil.ch, daniel.sage@epfl.ch, tatiana.smirnova.1@unil.ch
Betreff: “TANDEM DeepMarrow Position”

Ihre Bewerbung

Bewerbungen sollten ein Motivationsschreiben, einen vollständigen Lebenslauf und mindestens zwei Empfehlungsschreiben (einschließlich eines Schreibens des Doktorvaters, sofern nicht anderweitig begründet) enthalten.

Ausgewählte Kandidaten werden Mitte Januar für Interviews am Donnerstag, den 22. Januar, kontaktiert.

Bitte senden Sie Ihre vollständige Bewerbung im PDF-Format.
Bewerbungsschluss: 2. Januar 2026

Ausgewählte Kandidaten werden kontaktiert und zu Interviews im Januar 2026 eingeladen.

Nur Bewerbungen über diese Website, die an alle drei E-Mails gerichtet sind und mit dem angegebenen Betreff versehen sind, werden berücksichtigt.


Wir danken für Ihr Verständnis.

Zusätzliche Informationen

Die UNIL verpflichtet sich zu:
•    Gleichstellung, Vielfalt und Inklusion innerhalb ihrer Gemeinschaft;
•    Sicherstellung eines offenen und respektvollen Umfelds, das persönliche Entwicklung fördert;
•    Angebot von Arbeitsbedingungen, die die Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben erleichtern;
•    Unterstützung von Nachwuchswissenschaftlern.

unil.ch/equality
unil.ch/families
unil.ch/graduatecampus