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Vor 9 Stunden
Postdoktorand (Projektleiter) Computational Image Science in Infektionsbiologie
- 18 April 2026
- 100%
- Basel
Über den Job
Postdoktorand (Projektleiter) Computational Image Science in Infektionsbiologie
Arbeitsort Basel - Nordwestschweiz - SchweizKategoriePositionVeröffentlicht17. April 2026Postdoktorand (Projektleiter) Computational Image Science in Infektionsbiologie
Das Departement Biomedizin ist eine gemeinsame Initiative der Universität Basel und der Universitätsspitäler Basel. Es vereint Grundlagen- und klinische Wissenschaftler, um unser Verständnis von Gesundheit und Krankheit zu vertiefen und bahnbrechende Therapien zu entwickeln, die das Leben von Patienten in Bereichen mit ungedecktem Bedarf verbessern. Mit mehr als 70 Forschungsgruppen und 800 Mitarbeitenden ist das Departement Biomedizin die grösste Abteilung der Universität. Wir sind im Herzen von Basel an 6 verschiedenen Standorten angesiedelt. Werden Sie Teil unserer Zukunft!
Die Antibiotikatestung wird immer noch durch Messungen der Gesamtwachstumshemmung definiert. Wir wollen dieses Paradigma durch die Quantifizierung der Antibiotika-Wirkung auf Einzelzellebene ersetzen.
Das wissenschaftliche Ziel
Unser Labor hat eine groß angelegte Live-Cell-Imaging-Plattform etabliert, die Hunderte von Millionen einzelner Bakterien während der Antibiotikabehandlung verfolgt (Nature Microbiology, 2026). Diese Plattform ermöglicht systematische Bewertungen von Zehntausenden experimenteller Bedingungen über Bakterienspezies, klinische Stämme und verschiedene Medikamentenbehandlungen hinweg. Diese Experimente erfassen die Antibiotikaaktivität in Echtzeit auf Einzelzellebene. Doch ein Großteil der biologischen Informationen in diesen Daten bleibt unerforscht. Der nächste Schritt besteht darin, diese Zeitrafferbilder in genaue Einzelzelltrajektorien umzuwandeln und anschließend in Modelle der Antibiotikaantwort, mit direkter Relevanz für die Arzneimittelentwicklung und Patientenbehandlung. Wir (boecklab.com) suchen eine Wissenschaftlerin oder einen Wissenschaftler, die/der das rechnerische Rückgrat dieses Programms definieren wird.
Bewerbung / Kontakt
Bitte nutzen Sie den untenstehenden Link, um sich zu bewerben und folgende Unterlagen einzureichen:
www.unibas.ch ')
Das Departement Biomedizin ist eine gemeinsame Initiative der Universität Basel und der Universitätsspitäler Basel. Es vereint Grundlagen- und klinische Wissenschaftler, um unser Verständnis von Gesundheit und Krankheit zu vertiefen und bahnbrechende Therapien zu entwickeln, die das Leben von Patienten in Bereichen mit ungedecktem Bedarf verbessern. Mit mehr als 70 Forschungsgruppen und 800 Mitarbeitenden ist das Departement Biomedizin die grösste Abteilung der Universität. Wir sind im Herzen von Basel an 6 verschiedenen Standorten angesiedelt. Werden Sie Teil unserer Zukunft!
Die Antibiotikatestung wird immer noch durch Messungen der Gesamtwachstumshemmung definiert. Wir wollen dieses Paradigma durch die Quantifizierung der Antibiotika-Wirkung auf Einzelzellebene ersetzen.
Das wissenschaftliche Ziel
Unser Labor hat eine groß angelegte Live-Cell-Imaging-Plattform etabliert, die Hunderte von Millionen einzelner Bakterien während der Antibiotikabehandlung verfolgt (Nature Microbiology, 2026). Diese Plattform ermöglicht systematische Bewertungen von Zehntausenden experimenteller Bedingungen über Bakterienspezies, klinische Stämme und verschiedene Medikamentenbehandlungen hinweg. Diese Experimente erfassen die Antibiotikaaktivität in Echtzeit auf Einzelzellebene. Doch ein Großteil der biologischen Informationen in diesen Daten bleibt unerforscht. Der nächste Schritt besteht darin, diese Zeitrafferbilder in genaue Einzelzelltrajektorien umzuwandeln und anschließend in Modelle der Antibiotikaantwort, mit direkter Relevanz für die Arzneimittelentwicklung und Patientenbehandlung. Wir (boecklab.com) suchen eine Wissenschaftlerin oder einen Wissenschaftler, die/der das rechnerische Rückgrat dieses Programms definieren wird.
Ihre Position
Die erfolgreiche Kandidatin/der erfolgreiche Kandidat wird die rechnerische Einzelzell-Imaging-Plattform leiten. Dies umfasst die Entwicklung robuster Segmentierungs- und Tracking-Pipelines, die Entwicklung von Klassifikatoren für Wachstum und Lebensfähigkeit sowie die Etablierung skalierbarer Frameworks für verschiedene Bakterienspezies. Die Rolle beinhaltet auch die Identifikation dynamischer Phänotypen, die Definition von Deskriptoren der Antibiotikaantwort und die Integration dieser Messungen in Modelle. Die Kandidatin/der Kandidat wird Doktorierende mitbetreuen, zu Förderanträgen beitragen und die technische Leitung des rechnerischen Teils in einem hoch interdisziplinären Forschungsumfeld übernehmen.Ihr Profil
- Promotion in Computer Vision, Computational Biology, Physik oder einem verwandten Fachgebiet
- Nachgewiesene Expertise in der Bildanalyse und im Umgang mit groß angelegten Bilddatensätzen
- Fundierte Kenntnisse im Deep Learning (Segmentierung und Foundation--Modellarchitekturen)
- Nachgewiesene Fähigkeit, technische Projekte zu entwerfen und durchzuführen
- Wissenschaftliche Unabhängigkeit mit klarem Interesse an biologischen Mechanismen und klinischer Translation
- Kooperative Einstellung mit Begeisterung für Mentoring und Lehre von Nachwuchsforschenden
- Fließende Englischkenntnisse
Wir bieten Ihnen
- Zugang zu mehreren hundert Terabyte Bilddaten und starker Recheninfrastruktur
- Intellektuelles Eigentum an der rechnerischen Pipeline mit der Möglichkeit, deren wissenschaftliche Ausrichtung mitzugestalten
- Mitbetreuung von Doktorierenden und ggf. gemeinsame Erstautorenschaft
- Direkte translationale Integration durch Arzneimittelentwicklung und klinische Forschungskollaborationen
- Aktive Unterstützung bei Projekt- und Förderanträgen sowie Entwicklung eines unabhängigen wissenschaftlichen Profils
- Ein internationales, englischsprachiges Spitzenforschungsumfeld
- Wettbewerbsfähiges Gehalt und hohe Lebensqualität in der Schweiz
Bewerbung / Kontakt
Bitte nutzen Sie den untenstehenden Link, um sich zu bewerben und folgende Unterlagen einzureichen:
- Lebenslauf (mit Publikationsliste)
- Anschreiben mit Zusammenfassung bisheriger Erfolge und Forschungsinteressen (max. 1 Seite)
- Kontaktdaten von mindestens zwei Referenzen
www.unibas.ch ')
Bitte beziehen Sie sich in Ihrer Bewerbung auf myScience.ch und geben Sie die Referenz JobID69677 an.
