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Postdoktorandenstelle in der Molekularen Mikrobiologie
- 26 April 2026
- 100%
- Basel
Job-Zusammenfassung
Postdoktorand_in in Molekularbiologie an der Universität Basel. Eine spannende Gelegenheit zur Erforschung genetischer Faktoren von Antibiotika-Toleranz.
Aufgaben
- Untersuchung genetischer Grundlagen von Mycobacterium abscessus.
- Leitung eines Projekts in einem internationalen Konsortium.
- Integration von Genomdaten zur Modellierung von Toleranzphänotypen.
Fähigkeiten
- Doktortitel in Molekularbiologie oder verwandten Bereichen erforderlich.
- Erfahrung in molekularer Bakteriologie, z.B. CRISPRi.
- Grundkenntnisse in Programmierung für Datenanalysen.
Ist das hilfreich?
Über den Job
Postdoktorandenstelle in der Molekularen Mikrobiologie
Arbeitsort Basel - Nordwestschweiz - SchweizKategoriePositionVeröffentlicht24. April 2026Genetische Determinanten der Antibiotika-Toleranz bei Mykobakterien
Das Departement für Biomedizin ist eine gemeinsame Initiative der Universität Basel und der Universitätsspitäler Basel. Es vereint Grundlagen- und klinische Wissenschaftler, um unser Verständnis von Gesundheit und Krankheit zu vertiefen und Therapien für Bereiche mit ungedecktem medizinischem Bedarf zu entwickeln. Mit über 70 Forschungsgruppen und 800 Mitarbeitenden ist das Departement für Biomedizin die größte Abteilung der Universität, verteilt auf sechs Standorte im Stadtzentrum.
Die Stelle
Wir suchen eine/n Postdoktorand/in in der molekularen Mikrobiologie, um die genetischen Grundlagen der Medikamententoleranz bei Mycobacterium abscessus zu untersuchen, einem der am schwierigsten zu behandelnden bakteriellen Krankheitserreger. Die Stelle ist Teil eines neu finanzierten internationalen Konsortiums, das Experten für mykobakterielle Genetik, Hochdurchsatz-Phänotypisierung, Strukturbiologie und klinische Forschung aus der Schweiz, Israel, Australien und den USA zusammenbringt.
Das Projekt
Antibiotikabehandlungen bei M. abscessus schlagen bei mehr als der Hälfte der Patienten trotz in vitro Wirksamkeit fehl. Ein Hauptgrund ist die Medikamententoleranz, die Fähigkeit der Bakterien, Antibiotika-Exposition ohne klassische Resistenz zu überleben. Unser Labor ( boecklab.com ) hat eine groß angelegte Live-Cell-Imaging-Plattform entwickelt, die Hunderte Millionen Bakterien während der Antibiotika-Exposition verfolgt und so eine systematische Analyse der Abtötungsdynamik über Stämme und Medikamente hinweg ermöglicht. Mit diesem Ansatz konnten wir zeigen, dass das Überleben der Bakterien stark vom bakteriellen genetischen Hintergrund geprägt ist und die Behandlungsergebnisse vorhersagt ( Nature Microbiology, 2026 ). In diesem Projekt wollen wir nun die genetischen Determinanten des bakteriellen Überlebens und Todes identifizieren und einen artspezifischen Toleranzatlas erstellen, der Genotyp mit Phänotyp und klinischem Ergebnis verknüpft. Die Arbeit wird grundlegende Einblicke in die bakterielle Biologie liefern und Ziele für verbesserte Therapien identifizieren.
Ihre Position
Sie werden gepoolte CRISPRi-Bibliotheken über mehrere genetische Hintergründe von M. abscessus und infektionsrelevante Bedingungen generieren und screenen, wobei Sie lebensfähigkeitsbasierte Selektionsstrategien verwenden, um die bakterielle Abtötung im großen Maßstab zu quantifizieren. Sie werden diese Ergebnisse mit genomischen Daten von über 1.000 klinischen Isolaten integrieren, um prädiktive Modelle zu erstellen, die Genotypen mit Toleranzphänotypen und klinischen Ergebnissen verknüpfen. Sie werden das Projekt leiten und eine/n Doktorand/in mitbetreuen.Ihr Profil
Wir suchen Kandidaten mit einer starken Erfolgsbilanz in der molekularen Mikrobiologie.- Promotion in Molekularbiologie, Mikrobiologie oder einem verwandten Fachgebiet
- Expertise in molekularer Bakteriologie (z.B. CRISPRi, genetische Manipulation)
- Grundlegende Programmierkenntnisse (Python oder R) für Datenanalyse
- Fähigkeit, Experimente eigenständig zu entwerfen und durchzuführen
- Hohe Motivation, wissenschaftliche Neugier und Engagement
- Fähigkeit zur Zusammenarbeit und Betreuung von Nachwuchswissenschaftlern
- Vorteilhaft: Erfahrung mit Mykobakterien, Hochdurchsatz-Bildgebung und Screening-Methoden
Wir bieten Ihnen
- Eine voll finanzierte 4-jährige Postdoktorandenstelle in einem internationalen Konsortium
- Zugang zu modernsten Technologien (Automatisierung, Sequenzierung, Hochdurchsatz-Bildgebung etc.)
- Ein Projekt, das die Art und Weise, wie Antibiotika-Wirksamkeit verstanden und gemessen wird, neu gestalten wird
- Enge Integration mit Wirkstoffentwicklung und klinischer Forschung
- Unterstützung bei unabhängiger Finanzierung und Karriereentwicklung
- Wettbewerbsfähiges Gehalt und ausgezeichnete Lebensqualität in der Schweiz
Bewerbung / Kontakt
Bitte laden Sie eine einzige PDF-Datei hoch, die ein Motivationsschreiben, einen Lebenslauf, Kontaktdaten von mindestens zwei Referenzen und eine kurze Beschreibung eines Projekts enthält, das Sie verfolgen möchten. Bewerbungen werden fortlaufend geprüft, bis die Stelle besetzt ist.
www.unibas.ch ')
