Poste de doctorant en apprentissage statistique automatique pour la microscopie autonome 100%
Universität Bern
Bern
Infos sur l'emploi
- Date de publication :18 décembre 2025
- Taux d'activité :100%
- Lieu de travail :Bern
Résumé de l'emploi
Le laboratoire Pertz et le groupe Ginsbourger recherchent un doctorant.
Tâches
- Développer des modèles statistiques en temps réel pour la biologie.
- Créer des microscopes autonomes pour expérimentations sur cellules vivantes.
- Travailler dans des environnements interdisciplinaires de recherche.
Compétences
- Master en mathématiques, statistiques ou informatique requis.
- Compétences en modélisation statistique et théorie des probabilités.
- Expérience en programmation (Python, R, Julia, Matlab).
Est-ce utile ?
Poste conjoint – Laboratoire Pertz ( Institut de biologie cellulaire ) & Groupe Ginsbourger ( Institut de statistique mathématique & actuariat )
Nous recrutons un doctorant très motivé pour rejoindre un projet doctoral entièrement collaboratif à l’interface de l’apprentissage automatique, des statistiques et de la biologie cellulaire en temps réel.
Le poste est co-encadré par le Prof. Olivier Pertz (Biologie cellulaire) et le Prof. David Ginsbourger (Statistiques), et l’étudiant sera également intégré dans les deux environnements de recherche.
Votre environnement
Vous ferez partie de deux communautés de recherche complémentaires :
Laboratoire Pertz – Institut de biologie cellulaire (ICB)
Un groupe de premier plan pionnier dans le contrôle en temps réel de la dynamique de signalisation cellulaire utilisant la microscopie, l’imagerie quantitative et l’optogénétique. Équipe interdisciplinaire avec des liens étroits avec l’ingénierie et la science des données.
Groupe Ginsbourger – Institut de statistique mathématique et actuariat (IMSV)
Reconnu internationalement pour la modélisation par processus gaussiens, la conception bayésienne optimale et l’apprentissage automatique pour la découverte scientifique. Fortes collaborations entre mathématiques, apprentissage automatique et sciences appliquées.
Vous alternerez régulièrement entre les deux laboratoires et deviendrez fluent dans la communication interdisciplinaire - un atout majeur pour votre carrière.
Présentation du projet
Les cellules détectent, intègrent et répondent à des stimuli dynamiques via des réseaux de signalisation complexes. Le laboratoire Pertz a développé des outils optogénétiques puissants et des biosenseurs fluorescents permettant la perturbation directe et la mesure de ces réseaux par la lumière. Avec le groupe Ginsbourger, nous visons à créer
des microscopes autonomes « self-driving » qui :
- construisent des modèles statistiques des dynamiques biologiques en temps réel
- prédissent l’expérience suivante la plus informative
- l’exécutent automatiquement sur des cellules vivantes
Les méthodes clés incluront :
- Processus gaussiens (hétéroscédastiques & multivariés)
- Noyaux opérateurs et profonds
- Conception expérimentale bayésienne active
- Réseaux neuronaux informés par la physique
- Contrôle en boucle fermée des systèmes biologiques
Ce projet offre une opportunité rare de voir les modèles mathématiques prendre vie, guidant les expériences en temps réel.
Enseignement : Le poste inclut une petite charge d’enseignement en Statistiques → salaire majoré par rapport au financement doctoral standard en Suisse.
Pourquoi choisir Berne ?
- Université de recherche suisse de premier plan
- Communauté internationale, haute qualité de vie
- Accès facile à l’Europe
- Soutien exceptionnel pour les chercheurs en début de carrière
Votre profil
- Master en Mathématiques, Statistiques, Informatique, Ingénierie
- Compétences solides en modélisation statistique & théorie des probabilités
- Expérience en programmation (Python, R, Julia, Matlab...)
- Motivation à travailler étroitement avec des chercheurs expérimentaux
- Curiosité pour les systèmes biologiques - aucune expérience préalable en laboratoire humide requise !
Candidature
Veuillez soumettre votre candidature uniquement par voie électronique en un seul PDF contenant les documents suivants :
- courte lettre de motivation
- CV incluant mois/année
- relevés de notes BSc et MSc (dans une des langues officielles de Suisse, ou en anglais)
- coordonnées de deux références
- tout autre document pertinent
dans un seul email aux deux adresses :
olivier.pertz@unibe.ch
david.ginsbourger@unibe.ch
Les candidatures seront examinées au fur et à mesure jusqu’à ce que le poste soit pourvu.
