Chercheur postdoctoral en microbiote et immunité intestinale / immunopathologie 100 %

Au sein du groupe de recherche en immunopathologie, Institut de médecine tissulaire et de pathologie, Université de Berne, Suisse, le poste de chercheur postdoctoral en microbiote et immunité intestinale / immunopathologie.
sera disponible début 2026 pour étudier le dialogue moléculaire immuno-microbe-épithélial à la barrière intestinale et sa modulation par l'épissage de l'ARNm. Le projet proposé est financé par une subvention du Fonds national suisse de la recherche scientifique (FNS) jusqu'à fin 2029.

Les tissus épithéliaux forment la barrière primaire du corps face à l'environnement extérieur, maintenant un équilibre délicat entre tolérance aux microbes commensaux et défense contre les agents pathogènes. La perturbation de cet équilibre peut entraîner une inflammation chronique et contribuer au développement du cancer.

Nos travaux antérieurs ont montré que la perturbation de l'épissage alternatif de l'ARNm épithélial favorise les maladies intestinales (Mager et al., eLife 2017 ; Thoo et al., Cell Death & Disease 2019). Sur la base de ces résultats, nos données récentes non publiées indiquent que l'épissage aberrant reconfigure également le microenvironnement intestinal - modifiant la composition du microbiote et des populations cellulaires immunitaires résidentes. Ces changements semblent liés à des modifications des voies métaboliques et des mécanismes de signalisation spécifiques.

Dans ce projet, nous visons à élucider comment l'épissage de l'ARNm régule l'homéostasie intestinale et l'intégrité de la barrière. En utilisant des modèles murins gnotobiotiques et des échantillons dérivés de patients, nous identifierons les métabolites affectés par la dysrégulation de l'épissage et déterminerons comment ils influencent la fonction intestinale dans des conditions physiologiques et pathologiques.

Nous explorerons également le rôle des variants d'épissage épithéliaux dans le contrôle de la physiologie cellulaire et du potentiel tumorigène. Pour valider la pertinence clinique de nos résultats, nous réaliserons des études translationnelles utilisant des spécimens humains.

Ce projet offre une opportunité unique de maîtriser et d'intégrer un large éventail d'approches expérimentales. Les méthodologies incluront des techniques immunologiques et de biologie moléculaire, le séquençage ARN, la culture cellulaire, l'histologie et des analyses bioinformatiques sous la direction d'un expert interne. Ces méthodes seront appliquées à des modèles murins gnotobiotiques et conventionnels ainsi qu'à des spécimens de cancer colorectal dérivés de patients.

Ce projet implique de nombreuses collaborations et échanges scientifiques interdisciplinaires au sein de l'Université de Berne et avec d'autres collaborateurs scientifiques. Le candidat aura accès à un équipement scientifique de pointe en immunologie et aux plateformes centrales de cytométrie en flux et de séquençage de nouvelle génération, à une installation de souris exemptes de germes et gnotobiotiques, et bénéficiera du soutien de notre unité de recherche translationnelle interne (TRU) pour l'histologie et l'obtention d'échantillons dérivés de patients.

Ensemble, ces ressources et collaborations offrent un cadre exceptionnel pour mener des recherches à fort impact à l'interface de la biologie de l'ARN, de l'immunologie et de la médecine translationnelle.

Nous recherchons un chercheur postdoctoral très motivé titulaire d'un doctorat ou d'un MD/PhD en immunologie, microbiologie ou dans un domaine connexe. Le candidat idéal aura une expérience pratique avec des modèles murins, la biologie moléculaire, les techniques de culture cellulaire, le séquençage ARN (cellule unique et en masse) et la cytométrie en flux multicolore, ainsi qu'une connaissance opérationnelle des outils bioinformatiques. Une expertise supplémentaire en analyse du microbiote ou en microbiologie serait un atout important.

Le candidat doit être proactif, communicatif et capable de travailler de manière autonome ainsi qu'en équipe pluridisciplinaire. Une excellente maîtrise de l'anglais, de solides compétences organisationnelles et la capacité à maintenir des collaborations inter-départementales sont essentielles.

Ce poste offre une opportunité unique de collaborer avec des experts de divers horizons scientifiques et de contribuer à un domaine en rapide évolution à l'intersection de la biologie de l'ARN, de l'immunologie et de la recherche sur le microbiome.



Philippe Krebs, PhD, Prof., philippe.krebs@unibe.ch , Téléphone : +41 31 684 12 15

Candidature
Si votre profil correspond à nos exigences, nous attendons votre candidature avec le mot-clé "Postdoc Immunology". Le fichier PDF unique doit inclure :

• une lettre de motivation d'une page précisant votre expérience et vos qualités personnelles vous qualifiant pour ce poste (veuillez inclure la date de début souhaitée)
• CV et copies du diplôme de doctorat ou MD/PhD
• liste des publications, ainsi que les noms et numéros de téléphone/emails de trois référents à Philippe Krebs .

Le poste restera ouvert jusqu'à ce qu'un candidat approprié soit recruté.