Poste de doctorat à l'Institut de parasitologie 100%

Sujet de doctorat : Le métabolisme du ténia du renard Echinococcus multilocularis et son potentiel pour de nouveaux traitements ciblés contre l'échinococcosis alvéolaire

L'Institut de parasitologie de Berne mène des recherches sur les maladies parasitaires des animaux domestiques et de ferme, ainsi que des humains, et est impliqué dans l'enseignement, les services de diagnostic et le conseil.
En termes de recherche, nous nous concentrons sur l'étude des processus pathogènes qui se produisent lors des infections parasitaires, ainsi que sur le développement de nouvelles approches thérapeutiques. Les principaux sujets d'intérêt sont les helminthiases zoonotiques (échinococcosis, fasciolose) et les protozoaires causant des avortements (neosporose, toxoplasmose, tritrichomonose). Plus d'informations peuvent être trouvées sous le lien suivant : https://www.ipa.vetsuisse.unibe.ch/index_eng.html.
Contexte du projet : L'échinococcosis alvéolaire (AE) causée par le cestode Echinococcus multilocularis (petit ténia du renard) est la zoonose parasitaire d'origine alimentaire la plus répandue en Europe. Les métacestodes (stade larvaire) de E. multilocularis se développent principalement dans le foie de manière tumorale et infiltrative, et forment fréquemment des métastases dans d'autres organes. L'AE se manifeste chez les humains, les chiens, les singes et d'autres mammifères, et cause la mort si elle n'est pas traitée. L'AE ne peut pas être guérie par des médicaments, car les médicaments actuellement utilisés sont parasitostatiques et ne tuent pas le parasite. Pour ces raisons, de nouvelles options de traitement médicamenteux sont urgemment nécessaires.

Nous avons développé une culture in vitro du stade larvaire du parasite comme une alternative très précieuse au modèle animal. La culture in vitro est appliquée pour le dépistage de médicaments in vitro et les investigations sur le mode d'action des médicaments, ainsi que pour répondre à des questions fondamentales, cellulaires et biologiques moléculaires. Ces analyses sont complétées par des analyses transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques. Notre recherche s'est concentrée sur le métabolisme énergétique mitochondrial du parasite et l'interaction hôte-parasite.

Projet :
Nous avons identifié des aspects clés de l'acquisition d'énergie et de nutriments dans E. multilocularis. L'un d'eux est l'absorption de thréonine dépendante de la thréonine déshydrogénase (TDH), qui est cruciale pour la croissance et le développement du parasite, représentant une voie non fonctionnelle chez les humains (Kaethner et al., 2025, Int J Parasitol Drugs Drug Resist). Par conséquent, pour le projet proposé, le candidat validera l'expression de EmTDH à travers des analyses transcriptomiques, protéomiques et enzymatiques dans des échantillons d'humains et d'animaux infectés et évaluera les rôles essentiels de cette enzyme par RNAi. Des inhibiteurs spécifiques de TDH seront identifiés en dépistant des médicaments réaffectés sur les enzymes recombinantes de E. multilocularis et de souris. Nous évaluerons l'efficacité sur E. multilocularis par rapport aux cellules mammifères in vitro et dans le modèle murin AE, en évaluant les effets fonctionnels sur l'activité de TDH et en identifiant d'autres effets médicamenteux par identification via chromatographie d'affinité et protéomique.

Nous offrons donc à partir du 1er octobre 2025, ou sur rendez-vous, un poste de doctorat.

• Master en sciences naturelles, médecine vétérinaire ou humaine
• Grand intérêt et expérience en parasitologie (idéalement en helminthologie), biochimie, biologie cellulaire, analyse de données
• Esprit d'équipe
• Expérience approfondie avec les cultures cellulaires, les méthodes biologiques moléculaires et biochimiques
• Connaissances de base en biostatistique
• Travail avec des animaux de laboratoire
• Bonnes compétences en allemand et en anglais
• Très motivé, persévérant, curieux, créatif

• Équipe jeune et enthousiaste
• Collaboration étroite au sein de l'équipe et avec d'autres membres de l'Institut
• Méthodes parasitologiques, biologiques cellulaires, biologiques moléculaires et biochimiques établies
• Les doctorants feront partie de l'École doctorale des sciences cellulaires et biomédicales (http://www.gcb.unibe.ch)
• Financement par un projet financé par le Fonds national suisse de la recherche scientifique (SNSF) avec des collaborations nationales et internationales
• Contrat de doctorat de 4 ans
• Calculs de salaire suivant les directives de l'Université de Berne et du SNSF