Bioinformaticien / Biologiste Computationnel 100%

L'Institut d'Ophtalmologie Moléculaire et Clinique de Bâle (IOB) recherche un Bioinformaticien / Biologiste Computationnel hautement motivé pour analyser des données de génomique unicellulaire, avec un accent sur les mécanismes moléculaires de la myopie.

IOB est un institut de recherche associé à l'Université de Bâle qui combine recherche fondamentale et clinique. Sa mission est de stimuler les innovations dans la compréhension de la vision et de ses maladies et de développer de nouvelles thérapies pour la perte de vision.

En raison de la prévalence croissante de la myopie, elle deviendra la principale cause de cécité dans le monde, constituant l'un des défis majeurs de santé publique de notre époque. L'IOB utilise des techniques de pointe en génomique et épigénomique unicellulaire pour approfondir la compréhension mécanistique de la myopie au niveau des types cellulaires et des voies moléculaires, et pour tester de nouvelles thérapies destinées à arrêter ou inverser la progression de la myopie. Dans votre rôle, vous utiliserez votre expertise pour collaborer avec une équipe internationale multidisciplinaire et contribuer à des avancées majeures en médecine humaine.

• Analyser des ensembles de données -omiques divers, y compris RNA-seq unicellulaire, ATAC-seq et protéomique
• Créer des atlas de types cellulaires et les exploiter pour répondre à des questions de recherche biologique
• Soutenir l'ingénierie tissulaire et les efforts thérapeutiques en caractérisant les voies de signalisation intra/intercellulaires
• Comparer les types cellulaires malades à leurs homologues sains normaux
• Organiser les données de séquençage et maintenir les informations de métadonnées
• Participer au développement de pipelines pour automatiser les flux de travail couramment utilisés
• Communiquer clairement avec les biologistes et bioinformaticiens pour identifier les objectifs et transmettre les résultats

• Doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle ou discipline quantitative apparentée
• Minimum 3 ans d'expérience dans l'analyse de données de séquençage de nouvelle génération, de préférence incluant des données multi-omiques unicellulaires
• Expérience dans l'analyse de données transcriptomiques spatiales est un plus
• Compétence en Python, R et Unix/Linux requise. Expérience avec la gestion de flux de travail (Snakemake ou Nextflow) et le calcul haute performance ou cloud est souhaitable
• Connaissance approfondie des technologies de séquençage courantes
• Expérience dans le déchiffrement des voies de signalisation intra- et intercellulaires est souhaitable
• Excellentes compétences en communication écrite et orale en anglais

• Conditions très compétitives dans une communauté de recherche dynamique et internationale à Bâle
• Cinq semaines de congés pour tous les employés, avec un nombre croissant de jours de congé selon l'âge
• IOB est un employeur garantissant l'égalité des chances avec des politiques de travail favorables à la famille. Nous offrons une subvention pour la garde d'enfants et une salle familiale, entre autres formes de soutien
• Opportunités de croissance et de développement professionnel, y compris le soutien pour des formations et éducations supplémentaires
• La chance de faire partie d'un institut de recherche révolutionnaire. À l'IOB, votre travail aura une grande signification pour la société, votre expertise sera valorisée et vos capacités seront mises au défi

Candidature / Contact

Les candidats intéressés doivent soumettre leurs documents de candidature via notre plateforme de recrutement en ligne. Veuillez inclure une lettre de motivation, votre curriculum vitae ainsi que les certificats/diplômes pertinents.