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Il y a 12 heures
Chercheur postdoctoral (chef de projet) en science de l'image computationnelle en biologie des infections
- 19 mars 2026
- 100%
- Basel
Résumé de l'emploi
L'Université de Bâle recherche un postdoctorant en science de l'image. Un environnement de recherche stimulant et des opportunités de développement vous attendent.
Tâches
- Diriger la plateforme d'imagerie cellulaire individuelle.
- Développer des pipelines de segmentation et de suivi robustes.
- Superviser des doctorants et contribuer à des propositions de subventions.
Compétences
- Doctorat en vision par ordinateur ou biologie computationnelle requis.
- Expertise en analyse d'images et ensembles de données volumineux.
- Compétences en apprentissage profond et conception de projets techniques.
Est-ce utile ?
À propos de cette offre
Chercheur postdoctoral (chef de projet) en science de l'image computationnelle en biologie des infections
Lieu de travail Bâle - Nord-Ouest de la Suisse - SuisseCatégoriePostePublié18 mars 2026Chercheur postdoctoral (chef de projet) en science de l'image computationnelle en biologie des infections
Le Département de biomédecine est une collaboration entre l'Université de Bâle et les Hôpitaux universitaires de Bâle. Il réunit des scientifiques fondamentaux et cliniques pour faire progresser notre compréhension de la santé et de la maladie et développer des thérapies pionnières bénéficiant aux patients dans des domaines où les besoins ne sont pas satisfaits. Avec plus de 70 groupes de recherche et 800 employés, le Département de biomédecine est le plus grand département de l'Université. Nous sommes situés au cœur de Bâle sur 6 sites différents. Faites partie de notre avenir !
Les tests d'antibiotiques sont encore définis par des mesures d'inhibition de croissance en masse. Nous visons à remplacer ce paradigme en quantifiant l'action des antibiotiques à la résolution d'une seule cellule.
L'objectif scientifique
Notre laboratoire a mis en place une plateforme d'imagerie cellulaire en direct à grande échelle qui suit des centaines de millions de bactéries individuelles lors de l'exposition aux antibiotiques (Nature Microbiology, 2026). Cette plateforme permet des évaluations systématiques de dizaines de milliers de conditions expérimentales à travers des espèces bactériennes, des souches cliniques et divers traitements médicamenteux. Ces expériences capturent l'activité antibiotique en temps réel au niveau des cellules individuelles. Pourtant, une grande partie de l'information biologique contenue dans ces données reste inexplorée. L'étape suivante consiste à convertir ces images en time-lapse en trajectoires précises de cellules uniques puis en modèles de réponses aux antibiotiques, avec une pertinence directe pour le développement de médicaments et le traitement des patients. Nous (boecklab.com) recherchons un scientifique qui définira l'ossature computationnelle de ce programme.
Candidature / Contact
Veuillez utiliser le lien ci-dessous pour postuler et soumettre les documents suivants :
www.unibas.ch ')
Le Département de biomédecine est une collaboration entre l'Université de Bâle et les Hôpitaux universitaires de Bâle. Il réunit des scientifiques fondamentaux et cliniques pour faire progresser notre compréhension de la santé et de la maladie et développer des thérapies pionnières bénéficiant aux patients dans des domaines où les besoins ne sont pas satisfaits. Avec plus de 70 groupes de recherche et 800 employés, le Département de biomédecine est le plus grand département de l'Université. Nous sommes situés au cœur de Bâle sur 6 sites différents. Faites partie de notre avenir !
Les tests d'antibiotiques sont encore définis par des mesures d'inhibition de croissance en masse. Nous visons à remplacer ce paradigme en quantifiant l'action des antibiotiques à la résolution d'une seule cellule.
L'objectif scientifique
Notre laboratoire a mis en place une plateforme d'imagerie cellulaire en direct à grande échelle qui suit des centaines de millions de bactéries individuelles lors de l'exposition aux antibiotiques (Nature Microbiology, 2026). Cette plateforme permet des évaluations systématiques de dizaines de milliers de conditions expérimentales à travers des espèces bactériennes, des souches cliniques et divers traitements médicamenteux. Ces expériences capturent l'activité antibiotique en temps réel au niveau des cellules individuelles. Pourtant, une grande partie de l'information biologique contenue dans ces données reste inexplorée. L'étape suivante consiste à convertir ces images en time-lapse en trajectoires précises de cellules uniques puis en modèles de réponses aux antibiotiques, avec une pertinence directe pour le développement de médicaments et le traitement des patients. Nous (boecklab.com) recherchons un scientifique qui définira l'ossature computationnelle de ce programme.
Votre poste
Le candidat retenu dirigera la plateforme d'imagerie computationnelle à cellule unique. Cela inclut la conception de pipelines robustes de segmentation et de suivi, le développement de classificateurs de croissance et de viabilité, et l'établissement de cadres évolutifs à travers diverses espèces bactériennes. Le rôle implique également l'identification de phénotypes dynamiques, la définition de descripteurs de réponse aux antibiotiques, et l'intégration de ces mesures dans des modèles. Le candidat co-supervisera des doctorants, contribuera aux propositions de subventions, et assurera la direction technique de la partie computationnelle dans un environnement de recherche hautement interdisciplinaire.Votre profil
- Doctorat en vision par ordinateur, biologie computationnelle, physique ou discipline apparentée
- Expertise démontrée en analyse d'images et travail avec de grands ensembles de données d'imagerie
- Solide expertise en apprentissage profond (segmentation et architectures de modèles fondamentaux)
- Capacité démontrée à concevoir et exécuter des projets techniques
- Indépendance scientifique avec un intérêt clair pour les mécanismes biologiques et la traduction clinique
- Esprit collaboratif avec enthousiasme pour le mentorat et l'enseignement aux jeunes chercheurs
- Maîtrise de l'anglais
Nous vous offrons
- Accès à plusieurs centaines de téraoctets de données d'imagerie et une infrastructure informatique solide
- Propriété intellectuelle du pipeline computationnel avec opportunité de façonner sa direction scientifique
- Co-supervision d'étudiants doctorants et co-rédaction en tant qu'auteur correspondant lorsque approprié
- Intégration translationnelle directe via le développement de médicaments et les collaborations en recherche clinique
- Soutien actif pour le projet, les demandes de subventions, et le développement d'un profil scientifique indépendant
- Environnement de recherche international de pointe anglophone
- Salaire compétitif et haute qualité de vie en Suisse
Candidature / Contact
Veuillez utiliser le lien ci-dessous pour postuler et soumettre les documents suivants :
- CV (avec liste de publications)
- Lettre de motivation résumant les réalisations passées et les intérêts de recherche (1 page max.)
- Coordonnées d'au moins deux référents
www.unibas.ch ')
Dans votre candidature, veuillez mentionner myScience.ch et référencer JobID69506.
