Forschungsbeauftragte/r für bioinformatische Unterstützung

Einleitung

Die Universität Lausanne ist eine Hochschuleinrichtung für Lehre und Forschung, die aus sieben Fakultäten besteht, an denen etwa 14.300 Studierende und fast 3.800 Mitarbeitende, Professoren und Forschende arbeiten und studieren. Idealerweise am Genfersee gelegen, nahe dem Stadtzentrum von Lausanne, vereint ihr Campus über 120 Nationalitäten.

Präsentation

Das Departement für Fundamentale Mikrobiologie bietet eine Stelle als Forschungsassistent/in zur bioinformatischen Unterstützung an.

Stelleninformationen

Voraussichtliches Eintrittsdatum: zwischen 01.09.2026 und 01.11.2026 (flexibel)
Vertragsdauer: 1 Jahr (verlängerbar bis zu 4 Jahren)
Beschäftigungsgrad: 100%
Arbeitsort: Universität Lausanne

Ihre Aufgaben

Wir suchen eine/n motivierte/n Bioinformatiker/in zur Unterstützung der Forschungsgruppen im Departement für Fundamentale Mikrobiologie, insbesondere in Zusammenarbeit mit dem Nationalen Kompetenzzentrum für Forschung (NCCR) Microbiomes. Das NCCR Microbiomes kombiniert rechnerische, modellierende, ingenieurwissenschaftliche und synthetische Ansätze, um die einheitlichen Prinzipien der Mikrobiomfunktion zu verstehen, Werkzeuge zur Diagnose des Mikrobiomstatus zu entwickeln und Strategien zur Intervention und Wiederherstellung aus dem Gleichgewicht geratener Mikrobiome zu entwerfen. Die ausgewählte Person wird (i) bioinformatische Workflows zur Analyse von Mikrobiom-Sequenzierungsdatensätzen etablieren und umsetzen sowie offene Datenzugänglichkeit gewährleisten, (ii) bioinformatische Analysen und Datenmanagement von NCCR-bezogenen Projekten in den Forschungsgruppen unterstützen und anleiten, (iii) mit anderen NCCR Microbiomes-Gruppen bei der Entwicklung von Mikrobiom-Datenanalysen zusammenarbeiten und (iv) eigene Forschung im Kontext der Mikrobiomforschung durchführen.

Die ausgewählte Person wird in die Forschungsgruppe von Prof. Philipp Engel integriert, arbeitet jedoch eng mit dem NCCR-Datenmanagementpersonal und anderen NCCR-Bioinformatikern (z. B. an der ETHZ) zusammen. Wir bieten ein anregendes und internationales Forschungsumfeld mit Zugang zu modernsten Recheneinrichtungen.

Etwa 50 % der Arbeitszeit werden für die bioinformatische Unterstützung von NCCR Microbiomes-Projekten aufgewendet. 10 % entfallen auf die Lehre von Masterkursen im Zusammenhang mit NCCR Microbiomes. Die verbleibende Arbeitszeit kann für persönliche Forschung innerhalb der Gruppe von Prof. Engel genutzt werden.

Ihre Qualifikationen

Die Kandidaten sollten über eine Promotion in Lebenswissenschaften mit Schwerpunkt Bioinformatik in den Bereichen mikrobiologische Ökologie und Evolution/Mikrobiomforschung verfügen. Ein fundierter Hintergrund in experimentellem Design, Statistik, Shotgun-Metagenomik und mikrobiellen Genomanalysen ist zwingend erforderlich, ebenso wie umfassende Erfahrung im Betrieb und Aufbau bioinformatischer Pipelines in HPC-Umgebungen. Forschungserfahrung mit verschiedenen Mikrobiomen (z. B. Boden-, Pflanzen-, menschlichen oder tierischen Mikrobiomen) ist von Vorteil. Nachgewiesene Erfahrung mit UNIX, Python und R-Skripting ist obligatorisch.
Gute Englischkenntnisse, hohe persönliche Motivation zur Zusammenarbeit und Unterstützung von Forschungsprojekten sowie ausgeprägte Kommunikationsfähigkeiten werden erwartet. 

Was die Stelle Ihnen bietet

Unsere Vision ist es, Forschung an der Spitze unseres Fachgebiets durchzuführen und gleichzeitig ein freundliches und inklusives Umfeld zu schaffen, in dem junge Wissenschaftler aus unterschiedlichen Hintergründen gedeihen und sich gestärkt fühlen können.
Wir bieten zahlreiche Möglichkeiten für berufliche Weiterbildung, Lehre, Networking, Öffentlichkeitsarbeit und Publikationen. 

Kontakt für weitere Informationen

Prof. Philip Engel
Telefonnummer: 0041 21 692 5612

Ihre Bewerbung

Bewerbungsschluss: Bewerbungen werden fortlaufend geprüft.

Bitte fügen Sie Ihrer vollständigen Bewerbung ein Motivationsschreiben, einen Lebenslauf, eine Publikationsliste und weitere Nachweise (z. B. GitHub- oder Open-Data-Seiten) sowie die Kontaktdaten von zwei Referenzpersonen im Word- oder PDF-Format bei.
Nur Bewerbungen über diese Webseite werden berücksichtigt.

Wir danken für Ihr Verständnis.

Spezifikationen

Klicken Sie hier, um die Spezifikationen einzusehen

Zusätzliche Informationen

Die Universität fördert eine ausgewogene Vertretung von Männern und Frauen unter ihren Mitarbeitenden und ermutigt daher Frauen zur Bewerbung.