Postdoc-Stelle zur Entwicklung analytischer Pipelines und Analysen zur Erfassung invasiver gebietsfremder Arten in aquatischen Systemen mittels eDNA (2 Jahre)
- 10 Juli 2026
- 100%
- Festanstellung
- Dübendorf
Über den Job
Eawag, das Schweizerische Bundesinstitut für Gewässerwissenschaften und -technologie, ist ein international vernetztes Forschungsinstitut im Bereich der Aquatik innerhalb des ETH-Bereichs (Schweizerische Eidgenössische Technische Hochschulen). Eawag betreibt Forschung, Lehre und fachliche Beratung, um die doppelten Ziele zu erreichen, den direkten menschlichen Wasserbedarf zu decken und die Funktion und Integrität aquatischer Ökosysteme zu erhalten.
Postdoc-Stelle zur Entwicklung analytischer Pipelines und Analysen zur Erfassung invasiver gebietsfremder Arten in aquatischen Systemen mittels eDNA (2 Jahre)
Das Altermatt-Labor am Department für Aquatische Ökologie der Eawag und das Department für Evolutionsbiologie und Umweltstudien (IEU) an der Universität Zürich haben eine Vakanz für eine/n
Invasive gebietsfremde Arten (IAS) sind weltweit und national ein Haupttreiber des Biodiversitätsverlusts. IAS kommen in allen Ökosystemen vor, sind jedoch besonders in aquatischen Ökosystemen verbreitet und problematisch, da deren Management und Kontrolle, sobald sie etabliert sind, sehr schwierig oder sogar unmöglich ist. Folglich sind Prävention und Frühwarnung essenziell, und beide basieren auf Überwachung und Monitoring. Umwelt-DNA (eDNA) entwickelt sich als geeignetes Werkzeug für räumliche und zeitliche Überwachung sowie für die frühe Erkennung und das Monitoring der Ankunft und Etablierung von IAS, doch Generalisierung, Robustheit und Implementierung sind noch in der Entwicklung.
In diesem Postdoc-Projekt werden Sie analytische Pipelines etablieren und weiterentwickeln, um invasive gebietsfremde Arten anhand bestehender eDNA-Datensätze zu analysieren und zu erfassen. Der anfängliche Fokus liegt auf IAS in Mitteleuropa/Schweiz, aber die Pipelines sollen europaweit und darüber hinaus skalierbar sein. Eigene Beiträge und Ideen sind ausdrücklich erwünscht und es wird umfangreiche intellektuelle Freiheit zur Gestaltung des Projekts geboten.
Das Projekt umfasst: i) Aufbau von Referenzdatenbanken für IAS-Metabarcoding-Analysen (literaturbasiert/Daten-Mining über mehrere Marker/taxonomische Gruppen); ii) Entwicklung von End-to-End halbautomatisierten analytischen Pipelines für eDNA-Metabarcoding-Analysen im Hinblick auf IAS-Monitoring und -Detektion, die eine selbstgesteuerte Analyse von IAS-Signalen in eDNA-Metabarcoding-Datensätzen ermöglichen und Vertrauensmaße für IAS-Nachweise bereitstellen; iii) Proof-of-Principle-Tests und Anwendung dieser Pipelines auf bestehenden aquatischen eDNA-Datensätzen (Fische und Wirbellose), basierend auf hochauflösenden eDNA-Zeitreihen und über 250 Routine-Monitoring-Standorten in der Schweiz.
Das Projekt ist vollständig finanziert und verknüpft mit der NRP82-Initiative „Smart Monitoring of Swiss Waters (FutureProof)“ sowie einem Forschungsprojekt des Bundesamts für Umwelt (BAFU/FOEN). Die Ergebnisse des Projekts sollen in führenden peer-reviewed Fachzeitschriften veröffentlicht, den FAIR-Prinzipien folgen und auch in enger Zusammenarbeit mit Stakeholdern in anwendungsbereite Werkzeuge umgesetzt werden.
Die Stelle ist zu besetzen mit einer motivierten Person, die eine führende Rolle in fortgeschrittener Datenanalyse und Programmierung übernehmen kann, mit Fokus auf IAS-Bewertung in Süßwassersystemen mittels eDNA-Datensätzen.
Für die Bewerbung benötigen Sie einen Doktortitel in Molekularer Ökologie, Bioinformatik, Biodiversität oder Datenwissenschaften oder einem eng verwandten Fachgebiet. Sie sollten über Erfahrung in Bioinformatik und eDNA-Metabarcoding-Datenanalysen sowie Kenntnisse in der Analyse von Biodiversitäts-/IAS-Datensätzen verfügen. Allgemeine Programmier- und Datenanalyseerfahrung wird erwartet. Ein starkes konzeptionelles Fundament in molekularer Ökologie/Süßwasserökologie und ein gutes Verständnis ökologischer Theorie sind von Vorteil. Ein nachgewiesenes Interesse an offener und reproduzierbarer Wissenschaft (z. B. FAIR-Prinzipien, Erfahrung mit Versionskontrollsystemen) ist ein Plus. Die Arbeitssprache in den Gruppen ist Englisch. Fließende Sprachkenntnisse in Wort und Schrift sind erforderlich. Zusätzliche Deutsch- oder Französischkenntnisse für den Austausch mit Stakeholdern sind hilfreich.
Das Projekt wird geleitet von Prof. Dr Florian Altermatt an der Universität Zürich und der Eawag. Die erfolgreiche Bewerberin/der erfolgreiche Bewerber wird in der Gruppe von Prof. Dr Florian Altermatt ( www.altermattlab.ch ) an der Universität Zürich und der Eawag (Dübendorf, Schweiz) angestellt und tätig sein. Das Projekt ermöglicht Kooperationen mit nationalen/kantonalen Stakeholdern. Die Stelle ist für zwei Jahre vollständig finanziert und soll im 4. Quartal 2026 oder 1. Quartal 2027 beginnen.
Wir suchen eine hochmotivierte, begeisterte und selbstständige Person mit Leidenschaft für Wissenschaft und Umsetzung.
Bei Eawag herrscht ein Arbeitsumfeld, in dem Menschen mit unterschiedlichen Erfahrungen, Stärken und Perspektiven voll einbringen und sich weiterentwickeln können. Hier können Sie mithelfen, Fortschritte zu erzielen! Wir fördern echte Teilhabe, Austausch und gegenseitiges Verständnis. Wir schaffen Strukturen, die die Vereinbarkeit von Arbeit und anderen Lebensbereichen, wie Sorgearbeit, ermöglichen und bemühen uns kontinuierlich, Barrieren abzubauen.
Haben Sie spezielle Anforderungen bezüglich des Bewerbungsprozesses oder der Stelle oder benötigen Sie weitere Informationen? Sprechen Sie uns an – wir unterstützen Sie gerne mit möglichen flexiblen Arbeitsplatz-, Arbeitszeit- und Arbeitsgestaltungslösungen. Weitere Informationen finden Sie auf unserer Webseite zu Eawag sowie zu unseren Arbeitsbedingungen .
Bewerbungen müssen bis zum 14. August 2026 eingereicht werden. Ihre Bewerbung sollte ein Anschreiben enthalten, in dem Sie Ihre Interessen und deren Relevanz für diese Stelle darlegen, einen vollständigen Lebenslauf, Universitätszeugnisse sowie die Namen und Kontaktdaten von drei Referenzen.
Für weitere Fragen konsultieren Sie www.altermattlab.ch oder kontaktieren Sie Prof. Dr Florian Altermatt .
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über diese Webseite. Andere Bewerbungswege werden nicht berücksichtigt. Bitte klicken Sie auf den untenstehenden Button, der Sie direkt zum Bewerbungsformular führt.
In diesem Postdoc-Projekt werden Sie analytische Pipelines etablieren und weiterentwickeln, um invasive gebietsfremde Arten anhand bestehender eDNA-Datensätze zu analysieren und zu erfassen. Der anfängliche Fokus liegt auf IAS in Mitteleuropa/Schweiz, aber die Pipelines sollen europaweit und darüber hinaus skalierbar sein. Eigene Beiträge und Ideen sind ausdrücklich erwünscht und es wird umfangreiche intellektuelle Freiheit zur Gestaltung des Projekts geboten.
Das Projekt umfasst: i) Aufbau von Referenzdatenbanken für IAS-Metabarcoding-Analysen (literaturbasiert/Daten-Mining über mehrere Marker/taxonomische Gruppen); ii) Entwicklung von End-to-End halbautomatisierten analytischen Pipelines für eDNA-Metabarcoding-Analysen im Hinblick auf IAS-Monitoring und -Detektion, die eine selbstgesteuerte Analyse von IAS-Signalen in eDNA-Metabarcoding-Datensätzen ermöglichen und Vertrauensmaße für IAS-Nachweise bereitstellen; iii) Proof-of-Principle-Tests und Anwendung dieser Pipelines auf bestehenden aquatischen eDNA-Datensätzen (Fische und Wirbellose), basierend auf hochauflösenden eDNA-Zeitreihen und über 250 Routine-Monitoring-Standorten in der Schweiz.
Das Projekt ist vollständig finanziert und verknüpft mit der NRP82-Initiative „Smart Monitoring of Swiss Waters (FutureProof)“ sowie einem Forschungsprojekt des Bundesamts für Umwelt (BAFU/FOEN). Die Ergebnisse des Projekts sollen in führenden peer-reviewed Fachzeitschriften veröffentlicht, den FAIR-Prinzipien folgen und auch in enger Zusammenarbeit mit Stakeholdern in anwendungsbereite Werkzeuge umgesetzt werden.
Die Stelle ist zu besetzen mit einer motivierten Person, die eine führende Rolle in fortgeschrittener Datenanalyse und Programmierung übernehmen kann, mit Fokus auf IAS-Bewertung in Süßwassersystemen mittels eDNA-Datensätzen.
Für die Bewerbung benötigen Sie einen Doktortitel in Molekularer Ökologie, Bioinformatik, Biodiversität oder Datenwissenschaften oder einem eng verwandten Fachgebiet. Sie sollten über Erfahrung in Bioinformatik und eDNA-Metabarcoding-Datenanalysen sowie Kenntnisse in der Analyse von Biodiversitäts-/IAS-Datensätzen verfügen. Allgemeine Programmier- und Datenanalyseerfahrung wird erwartet. Ein starkes konzeptionelles Fundament in molekularer Ökologie/Süßwasserökologie und ein gutes Verständnis ökologischer Theorie sind von Vorteil. Ein nachgewiesenes Interesse an offener und reproduzierbarer Wissenschaft (z. B. FAIR-Prinzipien, Erfahrung mit Versionskontrollsystemen) ist ein Plus. Die Arbeitssprache in den Gruppen ist Englisch. Fließende Sprachkenntnisse in Wort und Schrift sind erforderlich. Zusätzliche Deutsch- oder Französischkenntnisse für den Austausch mit Stakeholdern sind hilfreich.
Das Projekt wird geleitet von Prof. Dr Florian Altermatt an der Universität Zürich und der Eawag. Die erfolgreiche Bewerberin/der erfolgreiche Bewerber wird in der Gruppe von Prof. Dr Florian Altermatt ( www.altermattlab.ch ) an der Universität Zürich und der Eawag (Dübendorf, Schweiz) angestellt und tätig sein. Das Projekt ermöglicht Kooperationen mit nationalen/kantonalen Stakeholdern. Die Stelle ist für zwei Jahre vollständig finanziert und soll im 4. Quartal 2026 oder 1. Quartal 2027 beginnen.
Wir suchen eine hochmotivierte, begeisterte und selbstständige Person mit Leidenschaft für Wissenschaft und Umsetzung.
Bei Eawag herrscht ein Arbeitsumfeld, in dem Menschen mit unterschiedlichen Erfahrungen, Stärken und Perspektiven voll einbringen und sich weiterentwickeln können. Hier können Sie mithelfen, Fortschritte zu erzielen! Wir fördern echte Teilhabe, Austausch und gegenseitiges Verständnis. Wir schaffen Strukturen, die die Vereinbarkeit von Arbeit und anderen Lebensbereichen, wie Sorgearbeit, ermöglichen und bemühen uns kontinuierlich, Barrieren abzubauen.
Haben Sie spezielle Anforderungen bezüglich des Bewerbungsprozesses oder der Stelle oder benötigen Sie weitere Informationen? Sprechen Sie uns an – wir unterstützen Sie gerne mit möglichen flexiblen Arbeitsplatz-, Arbeitszeit- und Arbeitsgestaltungslösungen. Weitere Informationen finden Sie auf unserer Webseite zu Eawag sowie zu unseren Arbeitsbedingungen .
Bewerbungen müssen bis zum 14. August 2026 eingereicht werden. Ihre Bewerbung sollte ein Anschreiben enthalten, in dem Sie Ihre Interessen und deren Relevanz für diese Stelle darlegen, einen vollständigen Lebenslauf, Universitätszeugnisse sowie die Namen und Kontaktdaten von drei Referenzen.
Für weitere Fragen konsultieren Sie www.altermattlab.ch oder kontaktieren Sie Prof. Dr Florian Altermatt .
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über diese Webseite. Andere Bewerbungswege werden nicht berücksichtigt. Bitte klicken Sie auf den untenstehenden Button, der Sie direkt zum Bewerbungsformular führt.
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