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Vor 9 Stunden
PhD-Stelle in experimenteller Mikrobiologie
- 23 April 2026
- 100%
- Basel
Über den Job
PhD-Stelle in experimenteller Mikrobiologie
Arbeitsort Basel - Nordwestschweiz - SchweizKategoriePositionVeröffentlicht22. April 2026Einzelzell-Analyse der Antibiotika-Toleranz bei Mykobakterien
Das Departement für Biomedizin ist eine gemeinsame Initiative der Universität Basel und der Universitätsspitäler Basel. Es vereint Grundlagen- und klinische Wissenschaftler, um unser Verständnis von Gesundheit und Krankheit zu vertiefen und Therapien für Bereiche mit ungedecktem medizinischem Bedarf zu entwickeln. Mit über 70 Forschungsgruppen und 800 Mitarbeitenden ist das Departement für Biomedizin die größte Abteilung der Universität, verteilt auf sechs Standorte im Stadtzentrum.
Ihre Position
Wir bieten eine PhD-Stelle in experimenteller Mikrobiologie zur Untersuchung der Antibiotika-Toleranz bei Mycobacterium abscessus, einem der am schwierigsten zu behandelnden bakteriellen Krankheitserreger. Die Stelle ist Teil eines neu finanzierten internationalen Konsortiums, das Experten für mykobakterielle Genetik, Hochdurchsatz-Phänotypisierung, Strukturbiologie und klinische Forschung aus der Schweiz, Israel, Australien und den USA zusammenbringt.Das Projekt
Antibiotikabehandlungen bei M. abscessus schlagen bei mehr als der Hälfte der Patienten trotz in vitro Wirksamkeit fehl. Ein Hauptgrund ist die Medikamententoleranz, die Fähigkeit der Bakterien, Antibiotika-Exposition ohne klassische Resistenz zu überleben. Unser Labor ( boecklab.com ) hat eine groß angelegte Live-Cell-Imaging-Plattform entwickelt, die Hunderte Millionen Bakterien während der Antibiotika-Exposition verfolgt und so eine systematische Analyse der Abtötungsdynamik ermöglicht. Mit diesem Ansatz haben wir gezeigt, dass das Überleben der Bakterien stark vom genetischen Hintergrund abhängt und die Behandlungsergebnisse vorhersagt ( Nature Microbiology, 2026 ). In diesem Projekt werden Sie diese Plattform nutzen, um das Überleben der Bakterien auf Einzelzellebene über Stämme, Medikamente und Umweltbedingungen hinweg zu quantifizieren und die molekularen Mechanismen zu identifizieren, die die Medikamententoleranz während der menschlichen Infektion beeinflussen.
Ihre Rolle
Sie führen Hochdurchsatz-Live-Cell-Imaging-Experimente durch und analysieren diese, um die bakterielle Lebensfähigkeit unter Antibiotika-Exposition unter verschiedenen Bedingungen und klinischen Isolaten zu quantifizieren. In enger Zusammenarbeit mit Postdoktoranden integrieren Sie diese Daten mit Ergebnissen aus CRISPRi- und Transposon-Mutagenese-Screens, um molekulare Mechanismen und M. abscessus-Genotypen zu identifizieren, die den Toleranz-Phänotypen zugrunde liegen. Ihre Arbeit umfasst systematisches experimentelles Design, die Erstellung groß angelegter Datensätze und die quantitative Analyse der Einzelzell-Zeit-Abtötungsdynamik. Sie tragen dazu bei, genetische Variation mit bakteriellen Überlebensstrategien zu verknüpfen und helfen, ein umfassendes Verständnis der Medikamententoleranz in klinisch relevanten Kontexten aufzubauen.
Ihr Profil
- MSc in Molekularbiologie, Mikrobiologie oder einem verwandten Fachgebiet
- Erfahrung in Mikrobiologie oder Molekularbiologie
- Interesse an der Kombination von computergestützten und experimentellen Ansätzen
- Hohe Motivation, wissenschaftliche Neugier und Engagement
- Fähigkeit, selbstständig und im Team zu arbeiten
- Gute Englischkenntnisse
Wir bieten Ihnen
- Eine voll finanzierte PhD-Stelle in einem hochgradig kollaborativen internationalen Konsortium
- Schulungen in modernsten Technologien, einschließlich Hochdurchsatz-Imaging und Automatisierungs-Workflows
- Ein Projekt, das die Art und Weise, wie Antibiotika-Wirksamkeit verstanden und gemessen wird, neu gestalten wird
- Ein dynamisches, internationales Forschungsumfeld in Basel
- Wettbewerbsfähiges Gehalt und ausgezeichnete Lebensqualität in der Schweiz
Bewerbung / Kontakt
Bitte laden Sie eine einzige PDF-Datei hoch, die ein Motivationsschreiben, einen Lebenslauf und Kontaktdaten von mindestens zwei Referenzen enthält. Bewerbungen werden fortlaufend geprüft, bis die Stelle besetzt ist.
www.unibas.ch ')
Bitte beziehen Sie sich in Ihrer Bewerbung auf myScience.ch und geben Sie die Referenz JobID69705 an.
