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Il y a 9 heures
Poste de doctorant en microbiologie expérimentale
- 23 avril 2026
- 100%
- Basel
À propos de cette offre
Poste de doctorant en microbiologie expérimentale
Lieu de travail Bâle - Nord-Ouest de la Suisse - SuisseCatégoriePostePublié22 avril 2026Analyse unicellulaire de la tolérance aux antibiotiques chez les mycobactéries
Le Département de biomédecine est une initiative conjointe de l’Université de Bâle et des Hôpitaux universitaires de Bâle. Il réunit des scientifiques fondamentaux et cliniques pour faire progresser notre compréhension de la santé et de la maladie et pour développer des thérapies dans des domaines où les besoins médicaux ne sont pas satisfaits. Avec plus de 70 groupes de recherche et 800 employés, le Département de biomédecine est le plus grand département de l’Université, réparti sur six sites dans le centre-ville.
Votre poste
Nous proposons un poste de doctorant en microbiologie expérimentale pour étudier la tolérance aux antibiotiques chez Mycobacterium abscessus, l’un des agents pathogènes bactériens les plus difficiles à traiter. Ce poste fait partie d’un consortium international nouvellement financé qui réunit des experts en génétique mycobactérienne, phénotypage à haut débit, biologie structurale et recherche clinique en Suisse, en Israël, en Australie et aux États-Unis.Le projet
Les traitements antibiotiques pour M. abscessus échouent chez plus de la moitié des patients malgré l’activité des médicaments in vitro. Une raison clé est la tolérance aux médicaments, la capacité des bactéries à survivre à l’exposition aux antibiotiques sans résistance classique. Notre laboratoire ( boecklab.com ) a développé une plateforme d’imagerie cellulaire en direct à grande échelle qui suit des centaines de millions de bactéries pendant l’exposition aux antibiotiques, permettant une analyse systématique de la dynamique de destruction. Grâce à cette approche, nous avons montré que la survie bactérienne est fortement influencée par le fond génétique bactérien et prédit les résultats du traitement ( Nature Microbiology, 2026 ). Dans ce projet, vous utiliserez cette plateforme pour quantifier la survie bactérienne au niveau unicellulaire à travers différentes souches, médicaments et conditions environnementales afin d’identifier les mécanismes moléculaires qui façonnent la tolérance aux médicaments lors de l’infection humaine.
Votre rôle
Vous réaliserez et analyserez des expériences d’imagerie cellulaire en direct à haut contenu pour quantifier la viabilité bactérienne sous exposition aux antibiotiques dans diverses conditions et isolats cliniques. En étroite collaboration avec des chercheurs postdoctoraux, vous intégrerez ces données avec les résultats des criblages CRISPRi et de mutagenèse par transposon pour identifier les mécanismes moléculaires et les génotypes de M. abscessus sous-jacents aux phénotypes de tolérance. Votre travail impliquera une conception expérimentale systématique, la génération de grands ensembles de données et une analyse quantitative de la dynamique de destruction unicellulaire. Vous contribuerez à relier la variation génétique aux stratégies de survie bactérienne et aiderez à construire une compréhension complète de la tolérance aux médicaments dans des contextes cliniquement pertinents.
Votre profil
- Master en biologie moléculaire, microbiologie ou discipline apparentée
- Expérience en microbiologie ou biologie moléculaire
- Intérêt pour la combinaison d’approches computationnelles et expérimentales
- Forte motivation, curiosité scientifique et dynamisme
- Capacité à travailler de manière autonome et en équipe
- Bonnes compétences en communication en anglais
Nous vous offrons
- Un poste de doctorant entièrement financé au sein d’un consortium international très collaboratif
- Une formation aux technologies de pointe, y compris l’imagerie à haut contenu et les flux de travail automatisés
- Un projet positionné pour remodeler la compréhension et la mesure de l’efficacité des antibiotiques
- Un environnement de recherche dynamique et international à Bâle
- Un salaire compétitif et une excellente qualité de vie en Suisse
Candidature / Contact
Veuillez télécharger un seul PDF, incluant une lettre de motivation, un CV et les coordonnées d’au moins deux références. Les candidatures seront examinées au fur et à mesure jusqu’à ce que le poste soit pourvu.
www.unibas.ch ')
Dans votre candidature, veuillez mentionner myScience.ch et référencer JobID69705.
