Postdoktorandenstelle in der Medizinischen Chemie

Genetische Determinanten der Antibiotika-Toleranz bei Mykobakterien

Das Departement für Biomedizin ist eine gemeinsame Initiative der Universität Basel und der Universitätsspitäler Basel. Es vereint Grundlagen- und klinische Wissenschaftler, um unser Verständnis von Gesundheit und Krankheit zu vertiefen und Therapien für Bereiche mit ungedecktem medizinischem Bedarf zu entwickeln. Mit über 70 Forschungsgruppen und 800 Mitarbeitenden ist das Departement für Biomedizin die grösste Abteilung der Universität, verteilt auf sechs Standorte im Stadtzentrum.

Die Position

Wir suchen eine/n Postdoktorand/in in molekularer Mikrobiologie, um die genetischen Grundlagen der Medikamententoleranz bei Mycobacterium abscessus, einem der am schwierigsten zu behandelnden bakteriellen Krankheitserreger, zu untersuchen. Die Position ist Teil eines neu finanzierten internationalen Konsortiums, das Experten für mykobakterielle Genetik, Hochdurchsatz-Phänotypisierung, Strukturbiologie und klinische Forschung aus der Schweiz, Israel, Australien und den USA zusammenbringt.

Das Projekt

Antibiotikabehandlungen bei M. abscessus schlagen bei mehr als der Hälfte der Patienten trotz in vitro Wirksamkeit fehl. Ein Hauptgrund ist die Medikamententoleranz, die Fähigkeit der Bakterien, Antibiotika-Exposition ohne klassische Resistenz zu überleben. Unser Labor ( boecklab.com ) hat eine groß angelegte Live-Cell-Imaging-Plattform entwickelt, die Hunderte Millionen Bakterien während der Antibiotika-Exposition verfolgt und so eine systematische Analyse der Abtötungsdynamik über Stämme und Medikamente hinweg ermöglicht. Mit diesem Ansatz haben wir gezeigt, dass das Überleben der Bakterien stark vom bakteriellen genetischen Hintergrund geprägt ist und den Behandlungserfolg vorhersagt ( Nature Microbiology, 2026 ). In diesem Projekt wollen wir nun die genetischen Determinanten des bakteriellen Überlebens und Todes identifizieren und einen artspezifischen Toleranzatlas erstellen, der Genotyp mit Phänotyp und klinischem Ergebnis verknüpft. Die Arbeit wird grundlegende Einblicke in die bakterielle Biologie liefern und Ziele für verbesserte Therapien identifizieren.

Ihre Position

Ihr Profil

• Promotion in Molekularbiologie, Mikrobiologie oder einem verwandten Fachgebiet
• Expertise in molekularer Bakteriologie (z.B. CRISPRi, genetische Manipulation)
• Grundlegende Programmierkenntnisse (Python oder R) für Datenanalyse
• Fähigkeit, Experimente eigenständig zu entwerfen und durchzuführen
• Hohe Motivation, wissenschaftliche Neugier und Engagement
• Fähigkeit zur Zusammenarbeit und Betreuung von Nachwuchswissenschaftlern
• Vorteilhaft: Erfahrung mit Mykobakterien, Hochdurchsatz-Bildgebung und Screening-Methoden

Wir bieten Ihnen

• Eine vollständig finanzierte 4-jährige Postdoktorandenstelle in einem internationalen Konsortium
• Zugang zu modernsten Technologien (Automatisierung, Sequenzierung, Hochdurchsatz-Bildgebung etc.)
• Ein Projekt, das die Art und Weise, wie Antibiotika-Wirksamkeit verstanden und gemessen wird, neu gestalten wird
• Enge Integration mit Wirkstoffentwicklung und klinischer Forschung
• Unterstützung bei unabhängiger Finanzierung und Karriereentwicklung
• Wettbewerbsfähiges Gehalt und ausgezeichnete Lebensqualität in der Schweiz