Poste postdoctoral en chimie médicinale

Déterminants génétiques de la tolérance aux antibiotiques chez les mycobactéries

Le Département de biomédecine est une initiative conjointe de l’Université de Bâle et des Hôpitaux universitaires de Bâle. Il réunit des scientifiques fondamentaux et cliniques pour faire progresser notre compréhension de la santé et de la maladie et pour développer des thérapies dans des domaines où les besoins médicaux ne sont pas satisfaits. Avec plus de 70 groupes de recherche et 800 employés, le Département de biomédecine est le plus grand département de l’Université, réparti sur six sites dans le centre-ville.

Le poste

Nous recherchons un chercheur postdoctoral en microbiologie moléculaire pour étudier la base génétique de la tolérance aux médicaments chez Mycobacterium abscessus, l’un des agents pathogènes bactériens les plus difficiles à traiter. Le poste fait partie d’un consortium international nouvellement financé qui réunit des experts en génétique mycobactérienne, phénotypage à haut débit, biologie structurale et recherche clinique en Suisse, en Israël, en Australie et aux États-Unis.

Le projet

Les traitements antibiotiques contre M. abscessus échouent chez plus de la moitié des patients malgré une activité in vitro des médicaments. Une raison clé est la tolérance aux médicaments, la capacité des bactéries à survivre à l’exposition aux antibiotiques sans résistance classique. Notre laboratoire ( boecklab.com ) a développé une plateforme d’imagerie cellulaire en direct à grande échelle qui suit des centaines de millions de bactéries pendant l’exposition aux antibiotiques, permettant une analyse systématique de la dynamique de destruction à travers les souches et les médicaments. Grâce à cette approche, nous avons montré que la survie bactérienne est fortement influencée par le fond génétique bactérien et prédit les résultats du traitement ( Nature Microbiology, 2026 ). Dans ce projet, nous visons maintenant à identifier les déterminants génétiques de la survie et de la mort bactériennes et à construire un atlas de tolérance à l’échelle de l’espèce reliant génotype, phénotype et résultat clinique. Ce travail fournira des connaissances fondamentales sur la biologie bactérienne et identifiera des cibles pour améliorer les thérapies.

Votre poste

Votre profil

• Doctorat en biologie moléculaire, microbiologie ou discipline apparentée
• Expertise en bactériologie moléculaire (par ex. CRISPRi, manipulation génétique)
• Compétences de base en programmation (Python ou R) pour l’analyse de données
• Capacité à concevoir et réaliser des expériences de manière autonome
• Forte motivation, curiosité scientifique et dynamisme
• Capacité à travailler en collaboration et à encadrer des chercheurs juniors
• Atout : expérience avec les mycobactéries, l’imagerie à haut contenu et les approches de criblage

Nous vous offrons

• Un poste postdoctoral entièrement financé de 4 ans au sein d’un consortium international
• Accès à des technologies de pointe (automatisation, séquençage, imagerie à haut contenu, etc.)
• Un projet positionné pour remodeler la compréhension et la mesure de l’efficacité des antibiotiques
• Une intégration étroite avec le développement de médicaments et la recherche clinique
• Un soutien pour le financement indépendant et le développement de carrière
• Un salaire compétitif et une excellente qualité de vie en Suisse