Postdoc-Stelle in der räumlichen Genomik aquatischer Wirbelloser (3 Jahre)
- 03 Juli 2026
- 100%
- Festanstellung
- Dübendorf
Über den Job
Eawag, das Schweizerische Bundesinstitut für Gewässerwissenschaften und -technologie, ist ein international vernetztes aquatisches Forschungsinstitut innerhalb des ETH-Bereichs (Schweizerische Eidgenössische Technische Hochschulen). Eawag betreibt Forschung, Lehre und fachliche Beratung, um die doppelten Ziele zu erreichen, den direkten menschlichen Wasserbedarf zu decken und die Funktion und Integrität aquatischer Ökosysteme zu erhalten.
Postdoc-Stelle in der räumlichen Genomik aquatischer Wirbelloser (3 Jahre)
Das Altermatt-Labor am Department für Aquatische Ökologie bei Eawag und das Department für Evolutionsbiologie und Umweltstudien (IEU) an der Universität Zürich haben eine Vakanz für eine/n
Genetische Vielfalt ist die Grundlage für natürliche Selektion und Anpassung an Umweltveränderungen und spiegelt zeitgenössische sowie vergangene Populationsdynamiken wider. Ihr Verständnis ist daher sowohl aus akademischer als auch aus Management-Perspektive zentral. Das gegenwärtige Verständnis genetischer Vielfalt ist jedoch noch verstreut und basiert weitgehend auf einer kleinen Anzahl genetischer Marker. Jüngste Fortschritte in der Analyse von Ganzgenom-Sequenzierungsdaten bieten beispiellose Möglichkeiten, intraspezifische genetische Vielfalt, Populationsstruktur und adaptive Vielfalt wesentlich detaillierter zu charakterisieren. Sie ermöglichen auch die Rekonstruktion der jüngsten demographischen Geschichte, einschließlich Mustern von Inzucht und Veränderungen der effektiven Populationsgröße (Ne), wodurch besonders gefährdete Populationen identifiziert werden können.
OneBioNet-G: Genetische Vielfalt von Schlüsselarten wirbelloser Tiere in kleinen Gewässern der Schweiz ist ein massenübergreifendes Projekt, das vom 2. Schweizer Biodiversitätsaktionsplan (AP SBS II) des Bundesamts für Umwelt (BAFU/FOEN) finanziert wird. Unser Ziel ist es, die genetische/genomische Vielfalt über mehrere aquatische Wirbellose in der Schweiz zu integrieren, um deren genetische Zusammensetzung und Konnektivität zu verstehen und diese mit zukünftigen Klima- und Landnutzungsänderungen im grossen Massstab zu verknüpfen.
In diesem Postdoc-Projekt werden Sie die genomische Vielfalt mehrerer aquatischer Schlüsselarten in einem räumlich expliziten Ansatz etablieren und analysieren. Dies umfasst insbesondere a) die de-novo-Sequenzierung und Assemblierung von Entwurfsgenomen für mehrere aquatische Insektenarten (Eintags-, Stein- und Köcherfliegen, EPT) sowie Amphipodenarten, b) die Erstellung genomischer Daten für ca. 2.000 Individuen aus dutzenden Populationen (unter Verwendung von Ganzgenom-Sequenzierung / ddRAD-Ansätzen), c) die Ableitung genetischer Vielfalt, Konnektivität und adaptiver genetischer Variation, einschließlich retrospektiver Veränderungen in Inzucht und effektiven Populationsgrössen, d) die Durchführung räumlich expliziter Analysen der genetischen/genomischen Vielfalt und deren Verknüpfung mit der Topologie von Flussnetzwerken, Umweltvariablen und biogeographischen Treibern sowie e) die Bewertung der Machbarkeit, Stärken und potenziellen Einschränkungen von populationsgenomischen Monitoring-Ansätzen für ein nationales Monitoringprogramm der genetischen Vielfalt.
Das Projekt wird vollständig vom BAFU/FOEN finanziert, ist mit der OneBioNet-Initiative "Advancing functional connectivity of ecologically valuable areas through a Social-Ecological System" verknüpft und baut auf einer Schweizer Pilotstudie zum Monitoring genetischer Vielfalt auf (siehe auch hier ). Das Projekt legt einen starken Fokus auf die Etablierung von genomischen Basisdaten für Schweizer aquatische Wirbellose und wird in enger Zusammenarbeit mit Stakeholdern durchgeführt.
Die Stelle ist mit einer motivierten Person zu besetzen, die eine führende Rolle in fortgeschrittenen genetischen Analysen übernehmen kann und über fundierte Expertise in Genomik, einschließlich Labor-, Bioinformatik- und räumlichen Analysen, verfügt.
Dieses Projekt baut auf Organismen auf, die im Rahmen repräsentativer Probennahmen (Schweizer Biodiversitätsmonitoring und Amphipod.ch) gesammelt wurden. Sie werden Entwurfsgenome für eine ausgewählte Gruppe von 3–5 EPT- und 2–3 Amphipodenarten erstellen, populationsbezogene WGS- und/oder ddRAD-Sequenzierungsdaten pro Art generieren (Projektleitung, jedoch mit umfangreicher Unterstützung durch Labortechniker) und genomweite genetische Vielfalt, adaptive genetische Vielfalt, genetische Konnektivität und räumliche Netzwerkstruktur, Inzucht sowie effektive Populationsgrössen analysieren. Sie leiten die Analyse, Implementierung dieser Indizes und entwickeln mögliche Monitoring-Strategien für das genetische Monitoring gemeinsam mit Stakeholdern.
Für die Bewerbung benötigen Sie einen Doktortitel in Molekularer Ökologie, Ökologie, Biodiversitätswissenschaften oder einem eng verwandten Fachgebiet. Sie müssen nachweisliche Labor- und Bioinformatikerfahrung in Ganzgenom-Sequenzierung und/oder ddRAD-Sequenzierungsansätzen sowie Kenntnisse in der Analyse genomischer Daten vorweisen. Erfahrung in Bioinformatik, räumlicher Verteilungsmodellierung oder Programmierung ist von Vorteil. Ein starkes konzeptionelles Fundament in molekularer Ökologie sowie ein gutes Verständnis ökologischer Theorie und Datenanalyse werden erwartet. Nachgewiesene Fähigkeiten im wissenschaftlichen Schreiben sind erforderlich. Die Arbeitssprache in den Gruppen ist Englisch. Fließende Sprachkenntnisse in Wort und Schrift sind erforderlich. Zusätzliche Deutsch- oder Französischkenntnisse sind für den Austausch mit Stakeholdern wünschenswert.
Das Gesamtprojekt wird von Prof. Dr Florian Altermatt an Eawag/UZH geleitet. Die erfolgreiche Bewerberin/der erfolgreiche Bewerber wird bei Eawag (Dübendorf, Schweiz) angestellt und tätig sein. Das Projekt umfasst Kooperationen mit Stakeholdern beim BAFU/FOEN, WSL, der Universität Lausanne und dem Genetic Diversity Centre (GDC) an der ETH Zürich. Das Projekt bietet der erfolgreichen Bewerberin/dem erfolgreichen Bewerber hohe Unabhängigkeit und Führungsverantwortung. Die Stelle ist für drei Jahre vollständig finanziert und soll im Herbst 2026 beginnen.
Wir suchen eine hochmotivierte, begeisterte und selbstständige Person mit Leidenschaft für Wissenschaft und Umsetzung.
Bei Eawag herrscht ein Arbeitsumfeld, in dem Menschen mit unterschiedlichen Erfahrungen, Stärken und Perspektiven voll einbringen und sich weiterentwickeln können. Hier können Sie mithelfen, Fortschritte zu erzielen! Wir fördern echte Teilhabe, Austausch und gegenseitiges Verständnis. Wir schaffen Strukturen, die die Vereinbarkeit von Arbeit und anderen Lebensbereichen, wie Pflegearbeit, ermöglichen, und bemühen uns kontinuierlich, Barrieren abzubauen.
Haben Sie spezielle Anforderungen bezüglich des Bewerbungsprozesses oder der Stelle, oder benötigen Sie weitere Informationen? Sprechen Sie mit uns darüber – wir unterstützen Sie gerne mit möglichen flexiblen Arbeitsplatz-, Arbeitszeit- und Arbeitsgestaltungslösungen. Weitere Informationen finden Sie auf unserer Webseite zu Eawag sowie zu unseren Arbeitsbedingungen .
Bewerbungen müssen bis zum 9. August 2026 eingereicht werden. Ihre Bewerbung sollte ein Anschreiben enthalten, in dem Sie Ihre Interessen und deren Relevanz für diese Stelle darlegen, einen vollständigen Lebenslauf, Universitätszeugnisse sowie die Namen und Kontaktdaten von drei Referenzen (alles in einer PDF-Datei).
Für weitere Fragen konsultieren Sie www.altermattlab.ch oder kontaktieren Sie Prof. Dr Florian Altermatt .
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über diese Webseite. Andere Bewerbungswege werden nicht berücksichtigt. Bitte klicken Sie auf den untenstehenden Button, der Sie direkt zum Bewerbungsformular führt.
OneBioNet-G: Genetische Vielfalt von Schlüsselarten wirbelloser Tiere in kleinen Gewässern der Schweiz ist ein massenübergreifendes Projekt, das vom 2. Schweizer Biodiversitätsaktionsplan (AP SBS II) des Bundesamts für Umwelt (BAFU/FOEN) finanziert wird. Unser Ziel ist es, die genetische/genomische Vielfalt über mehrere aquatische Wirbellose in der Schweiz zu integrieren, um deren genetische Zusammensetzung und Konnektivität zu verstehen und diese mit zukünftigen Klima- und Landnutzungsänderungen im grossen Massstab zu verknüpfen.
In diesem Postdoc-Projekt werden Sie die genomische Vielfalt mehrerer aquatischer Schlüsselarten in einem räumlich expliziten Ansatz etablieren und analysieren. Dies umfasst insbesondere a) die de-novo-Sequenzierung und Assemblierung von Entwurfsgenomen für mehrere aquatische Insektenarten (Eintags-, Stein- und Köcherfliegen, EPT) sowie Amphipodenarten, b) die Erstellung genomischer Daten für ca. 2.000 Individuen aus dutzenden Populationen (unter Verwendung von Ganzgenom-Sequenzierung / ddRAD-Ansätzen), c) die Ableitung genetischer Vielfalt, Konnektivität und adaptiver genetischer Variation, einschließlich retrospektiver Veränderungen in Inzucht und effektiven Populationsgrössen, d) die Durchführung räumlich expliziter Analysen der genetischen/genomischen Vielfalt und deren Verknüpfung mit der Topologie von Flussnetzwerken, Umweltvariablen und biogeographischen Treibern sowie e) die Bewertung der Machbarkeit, Stärken und potenziellen Einschränkungen von populationsgenomischen Monitoring-Ansätzen für ein nationales Monitoringprogramm der genetischen Vielfalt.
Das Projekt wird vollständig vom BAFU/FOEN finanziert, ist mit der OneBioNet-Initiative "Advancing functional connectivity of ecologically valuable areas through a Social-Ecological System" verknüpft und baut auf einer Schweizer Pilotstudie zum Monitoring genetischer Vielfalt auf (siehe auch hier ). Das Projekt legt einen starken Fokus auf die Etablierung von genomischen Basisdaten für Schweizer aquatische Wirbellose und wird in enger Zusammenarbeit mit Stakeholdern durchgeführt.
Die Stelle ist mit einer motivierten Person zu besetzen, die eine führende Rolle in fortgeschrittenen genetischen Analysen übernehmen kann und über fundierte Expertise in Genomik, einschließlich Labor-, Bioinformatik- und räumlichen Analysen, verfügt.
Dieses Projekt baut auf Organismen auf, die im Rahmen repräsentativer Probennahmen (Schweizer Biodiversitätsmonitoring und Amphipod.ch) gesammelt wurden. Sie werden Entwurfsgenome für eine ausgewählte Gruppe von 3–5 EPT- und 2–3 Amphipodenarten erstellen, populationsbezogene WGS- und/oder ddRAD-Sequenzierungsdaten pro Art generieren (Projektleitung, jedoch mit umfangreicher Unterstützung durch Labortechniker) und genomweite genetische Vielfalt, adaptive genetische Vielfalt, genetische Konnektivität und räumliche Netzwerkstruktur, Inzucht sowie effektive Populationsgrössen analysieren. Sie leiten die Analyse, Implementierung dieser Indizes und entwickeln mögliche Monitoring-Strategien für das genetische Monitoring gemeinsam mit Stakeholdern.
Für die Bewerbung benötigen Sie einen Doktortitel in Molekularer Ökologie, Ökologie, Biodiversitätswissenschaften oder einem eng verwandten Fachgebiet. Sie müssen nachweisliche Labor- und Bioinformatikerfahrung in Ganzgenom-Sequenzierung und/oder ddRAD-Sequenzierungsansätzen sowie Kenntnisse in der Analyse genomischer Daten vorweisen. Erfahrung in Bioinformatik, räumlicher Verteilungsmodellierung oder Programmierung ist von Vorteil. Ein starkes konzeptionelles Fundament in molekularer Ökologie sowie ein gutes Verständnis ökologischer Theorie und Datenanalyse werden erwartet. Nachgewiesene Fähigkeiten im wissenschaftlichen Schreiben sind erforderlich. Die Arbeitssprache in den Gruppen ist Englisch. Fließende Sprachkenntnisse in Wort und Schrift sind erforderlich. Zusätzliche Deutsch- oder Französischkenntnisse sind für den Austausch mit Stakeholdern wünschenswert.
Das Gesamtprojekt wird von Prof. Dr Florian Altermatt an Eawag/UZH geleitet. Die erfolgreiche Bewerberin/der erfolgreiche Bewerber wird bei Eawag (Dübendorf, Schweiz) angestellt und tätig sein. Das Projekt umfasst Kooperationen mit Stakeholdern beim BAFU/FOEN, WSL, der Universität Lausanne und dem Genetic Diversity Centre (GDC) an der ETH Zürich. Das Projekt bietet der erfolgreichen Bewerberin/dem erfolgreichen Bewerber hohe Unabhängigkeit und Führungsverantwortung. Die Stelle ist für drei Jahre vollständig finanziert und soll im Herbst 2026 beginnen.
Wir suchen eine hochmotivierte, begeisterte und selbstständige Person mit Leidenschaft für Wissenschaft und Umsetzung.
Bei Eawag herrscht ein Arbeitsumfeld, in dem Menschen mit unterschiedlichen Erfahrungen, Stärken und Perspektiven voll einbringen und sich weiterentwickeln können. Hier können Sie mithelfen, Fortschritte zu erzielen! Wir fördern echte Teilhabe, Austausch und gegenseitiges Verständnis. Wir schaffen Strukturen, die die Vereinbarkeit von Arbeit und anderen Lebensbereichen, wie Pflegearbeit, ermöglichen, und bemühen uns kontinuierlich, Barrieren abzubauen.
Haben Sie spezielle Anforderungen bezüglich des Bewerbungsprozesses oder der Stelle, oder benötigen Sie weitere Informationen? Sprechen Sie mit uns darüber – wir unterstützen Sie gerne mit möglichen flexiblen Arbeitsplatz-, Arbeitszeit- und Arbeitsgestaltungslösungen. Weitere Informationen finden Sie auf unserer Webseite zu Eawag sowie zu unseren Arbeitsbedingungen .
Bewerbungen müssen bis zum 9. August 2026 eingereicht werden. Ihre Bewerbung sollte ein Anschreiben enthalten, in dem Sie Ihre Interessen und deren Relevanz für diese Stelle darlegen, einen vollständigen Lebenslauf, Universitätszeugnisse sowie die Namen und Kontaktdaten von drei Referenzen (alles in einer PDF-Datei).
Für weitere Fragen konsultieren Sie www.altermattlab.ch oder kontaktieren Sie Prof. Dr Florian Altermatt .
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung über diese Webseite. Andere Bewerbungswege werden nicht berücksichtigt. Bitte klicken Sie auf den untenstehenden Button, der Sie direkt zum Bewerbungsformular führt.
Eawag: Schweizerisches Bundesinstitut für Gewässerwissenschaften und -technologie
