Lausanne
Poste postdoctoral en signalisation lipidique nucléaire et résistance à l'insuline dans le muscle squelettique
- 23 octobre 2026
- 100%
- Lausanne
À propos de cette offre
Introduction
L'UNIL est une institution internationale de premier plan en enseignement et recherche, avec plus de 5 000 employés et 17 000 étudiants répartis entre son campus de Dorigny, le CHUV et Epalinges. En tant qu'employeur, l'UNIL encourage l'excellence, la reconnaissance individuelle et la responsabilité.
Présentation
Nous recherchons un chercheur postdoctoral pour diriger un projet testant si des espèces définies de diacylglycérols (DAG) nucléaires régulent de manière causale l'action de l'insuline dans le muscle squelettique humain. Le projet combine des DAGs photocagés ancrés et marqués, libérés par la lumière au niveau de l'enveloppe nucléaire de myotubes humains primaires, avec des mesures fonctionnelles, transcriptomiques et mitochondriales à résolution temporelle. Ces résultats cellulaires seront intégrés avec la lipidomique DAG résolue par organelle et le RNA-seq sur des biopsies musculaires squelettiques appariées collectées avant et après intervention dans une étude avec des volontaires.
Le poste est basé au laboratoire Métabolisme du Muscle et Vieillissement dirigé par la Prof. Francesca Amati (Département des Sciences biomédicales, UNIL) et implique une collaboration étroite avec des laboratoires partenaires spécialisés en chimie des lipides photocagés (EPFL, Suisse) et lipidomique DAG (University of Colorado Anschutz Medical Campus, USA).
Informations sur le poste
Date de début prévue : janvier 2027
Durée du contrat : 1 an, renouvelable si financement disponible
Taux d'activité : 100%
Lieu de travail : Département des Sciences biomédicales, Université de Lausanne, Rue du Bugnon 7, CH-1005 Lausanne
Vos responsabilités
Le chercheur postdoctoral concevra, réalisera et coordonnera le projet, depuis la validation des outils dans des cellules musculaires humaines jusqu'à l'intégration avec les données humaines. Plus précisément, il/elle devra :
• Établir des ancrages Tag à l'enveloppe nucléaire dans des myoblastes humains primaires par transfection et valider la localisation et la libération contrôlée par la lumière de sondes DAG photocagées sn-1,2 et 1,3 appariées en utilisant l'imagerie confocale, des biosenseurs DAG et la lipidomique fractionnée.
• Quantifier la synthèse de glycogène stimulée par l'insuline en utilisant du glucose radiomarquée et le signal de l'insuline après libération nucléaire de DAG, suivi par RNA-seq en masse et respirométrie Seahorse.
• Réaliser une fractionnement subcellulaire, une lipidomique ciblée DAG et un RNA-seq en masse sur des biopsies musculaires squelettiques appariées pré- et post-intervention, et intégrer ces données avec des phénotypes de clamp au glucose, flexibilité métabolique et composition corporelle en utilisant des modèles à effets mixtes.
• Analyser les données transcriptomiques et d'imagerie avec des workflows reproductibles et contrôlés en version et appliquer les pratiques de gestion FAIR des données.
• Coordonner les échanges scientifiques avec les laboratoires partenaires en chimie et lipidomique, co-encadrer des étudiants et contribuer à l'enseignement au laboratoire.
• Diffuser les résultats via des publications en tant que premier auteur, des conférences internationales et des activités de sensibilisation en français et en anglais, et préparer des demandes de financement indépendantes.
Vos qualifications
Le candidat doit être titulaire d'un doctorat en biologie, physiologie ou sciences biomédicales, obtenu dans les cinq dernières années, avec une thèse doctorale, et une solide expérience sur la régulation du métabolisme du muscle squelettique par des lipides bioactifs, de préférence sphingolipides/céramides ou diacylglycérols. Un double parcours académique combinant un diplôme en biotechnologie ou bioingénierie et un diplôme en sciences du sport ou de l'exercice est requis.
Compétences requises :
• Un historique de publications en tant que premier auteur sur la résistance à l'insuline induite par les lipides et le métabolisme du muscle squelettique, y compris des publications méthodologiques.
• Expertise pratique en culture de cellules musculaires squelettiques humaines primaires (myoblastes et myotubes), transfection cellulaire, et essais de flux métabolique radiomarqués (synthèse de glycogène, captation et oxydation du glucose, oxydation des acides gras).
• Expérience en recherche animale et humaine : modèles murins in vivo de maladies métaboliques (tests de tolérance au glucose et à l'insuline, composition corporelle, sensibilité à l'insuline ex vivo) et participation à des études cliniques humaines d'activité physique ou d'inactivité combinant phénotypage clinique et analyses ex vivo du muscle squelettique.
• Connaissance de la diversité des espèces lipidiques et de la localisation subcellulaire des lipides, et expérience dans l'interprétation des données lipidomiques dans le contexte de la résistance à l'insuline.
• Analyse RNA-seq en masse et codage avancé en R et Python, incluant le développement de pipelines d'apprentissage profond pour la segmentation d'images de microscopie et le phénotypage quantitatif des cellules musculaires, publiés en code open-source.
• Microscopie à fluorescence en champ large et confocale et analyse quantitative d'images.
• Financement compétitif obtenu en tant qu'investigateur principal, en plus des bourses doctorales ou postdoctorales.
• Expérience d'enseignement en physiologie de l'exercice et biologie cellulaire aux niveaux BSc et MSc, et co-encadrement d'étudiants MSc ou ingénieurs.
• Maîtrise du français et de l'anglais, avec la capacité de rédiger des textes scientifiques et de communiquer avec un public non spécialiste dans les deux langues.
Qualités personnelles :
Le candidat idéal est indépendant, rigoureux et bien organisé, capable de coordonner des collaborations internationales, et motivé pour développer une ligne de recherche indépendante sur la signalisation lipidique compartimentée dans un environnement de laboratoire collaboratif.
Ce que le poste vous offre
Nous offrons un cadre de travail agréable dans un environnement académique multiculturel, diversifié et dynamique. Des opportunités de formation professionnelle, de nombreuses activités et d'autres avantages à découvrir.
Contact pour plus d'informations
Prof. Francesca Amati
Département de Sciences biomédicales,
Université de Lausanne
Rue du Bugnon 7
CH-1005 Lausanne
Votre candidature
Date limite : 02.11.2026
Les candidatures sont invitées sous forme d'une lettre de motivation, d'un curriculum vitae, d'une brève description de l'expérience de recherche et de la thèse doctorale, ainsi que des noms et adresses de trois références académiques, avant novembre 2026. Les candidatures doivent également inclure une déclaration de recherche (maximum deux pages) décrivant comment le candidat établirait un lien causal entre des espèces spécifiques de diacylglycérols nucléaires et l'action de l'insuline dans des myotubes humains primaires utilisant des lipides photocagés, et comment il intégrerait ces résultats avec des données lipidomiques et transcriptomiques issues de biopsies musculaires squelettiques humaines appariées. Les candidatures sans cette déclaration ne seront pas prises en compte. Veuillez envoyer votre candidature complète en Word ou PDF. Seules les candidatures via ce site web seront considérées.
Nous vous remercions de votre compréhension.
Informations complémentaires
L'UNIL s'engage à :
• l'égalité, la diversité et l'inclusion au sein de sa communauté ;
• garantir un environnement ouvert et respectueux propice au développement personnel ;
• offrir des conditions de travail facilitant l'équilibre vie professionnelle-vie privée ;
• soutenir les chercheurs en début de carrière.
