Bourse postdoctorale en apprentissage automatique et prédiction des maladies

Recherche

Bourse postdoctorale en apprentissage automatique et prédiction des maladies

Êtes-vous intéressé par une bourse postdoctorale, entièrement financée par le Fonds national suisse de la recherche scientifique (FNS) et dans l'équipe du professeur Oliver Y. Chén ? Dans ce cas, continuez à lire ! 👇

Contexte

Le Centre hospitalier universitaire vaudois (CHUV) est l'un des cinq hôpitaux universitaires de Suisse. Grâce à sa collaboration avec la Faculté de biologie et de médecine de l'Université de Lausanne et l'EPFL, le CHUV joue un rôle de premier plan dans les soins médicaux, la recherche médicale et l'éducation.

Vous voyagerez avec nous dans les aventures suivantes :

a) Construire de nouvelles méthodes statistiques/d'apprentissage automatique pour étudier des données à grande échelle, potentiellement de haute dimension et multimodales

b) Prédiction des maladies

c) Découverte de biomarqueurs basée sur l'apprentissage automatique.

Le boursier postdoctoral aura des affiliations conjointes avec le Centre hospitalier universitaire vaudois (CHUV) et l'Université de Lausanne.

Que fait notre groupe ?

Nous développons de nouvelles méthodes d'apprentissage automatique et statistiques et étudions des données à grande échelle en santé et en maladie. Nos données proviennent de sources diverses, de l'imagerie cérébrale (par exemple, IRM et EEG), du séquençage, de la cytométrie/spectrométrie de masse, et des dossiers de santé, à des données provenant d'appareils numériques tels que les smartphones.

Notre objectif est triple :

a) Construire de nouveaux modèles méthodologiquement passionnants pour résoudre des problèmes du monde réel

b) Utiliser ces méthodes pour étudier les interactions entre des caractéristiques multimodales, multivariées et de haute dimension à grande échelle, et quand/comment elles peuvent être associées aux maladies de manière transversale et longitudinale et identifier des marqueurs qui soutiennent le diagnostic et le pronostic des patients

c) Traduire nos algorithmes en soutien à la décision clinique et en applications de gestion de la santé des patients.

Mission

Avec cette bourse postdoctorale, vous travaillerez principalement sur ces objectifs :

• Développer de nouvelles méthodes d'apprentissage automatique pour améliorer l'identification des patients atteints de maladies cérébrales, telles que la maladie d'Alzheimer (MA). Concevoir de nouvelles méthodes d'apprentissage automatique pour identifier les patients en utilisant des données multimodales à grande échelle, potentiellement de haute dimension
• Découvrir des biomarqueurs prédictifs de la gravité de la maladie. Développer des méthodes efficaces pour découvrir des biomarqueurs, y compris des biomarqueurs graphiques à partir de données unidimensionnelles ou multimodales
• Construire des logiciels pour effectuer une sélection automatisée de biomarqueurs et une prédiction des maladies via l'apprentissage automatique. Développer des logiciels, des boîtes à outils et des applications qui peuvent améliorer l'efficacité de la découverte de biomarqueurs et de la prédiction des maladies en s'appuyant sur les insights de (1) et (2).

Vous aurez la liberté de proposer et de développer des études indépendantes ou de rejoindre d'autres projets dans le cadre des objectifs plus larges de cette bourse et de collaborer avec ou de visiter d'autres équipes.

De plus, vous travaillerez dans un environnement interdisciplinaire et multiculturel.

Profil

Qualifications minimales :

• Doctorat (ou défense de doctorat réussie avant de commencer le poste), idéalement avec une expérience en apprentissage automatique, de préférence en théorie des graphes et en sciences du cerveau
• Intérêt pour le développement de nouvelles méthodes et applications pour résoudre des problèmes du monde réel
• Fort intérêt pour la visualisation des données
• Antécédents de publication prouvés
• Maîtrise de l'anglais
• Esprit d'équipe avec une passion pour la collaboration interdisciplinaire.

Qualifications souhaitées :

• Solides compétences en programmation en MATLAB, R et/ou Python
• Expérience en apprentissage automatique (y compris la théorie des graphes), modélisation statistique et contrôle de version.

Nous offrons

Que proposons-nous ?

• Une bourse postdoctorale sponsorisée par le FNS
• Affiliations conjointes avec le Centre hospitalier universitaire vaudois (CHUV) et l'Université de Lausanne
• Un environnement interdisciplinaire et une équipe de soutien. Nous nous efforçons d'atteindre l'égalité, la diversité et l'inclusion. Notre équipe est interdisciplinaire et multiculturelle, et nous encourageons les groupes sous-représentés à postuler
• Possibilité de collaborer avec et de visiter des collègues externes chez F. Hoffmann-La Roche, l'Université Johns Hopkins, KU Leuven, l'Université de Bristol, l'Université d'Oxford, l'Université de Pennsylvanie, l'Université libre de Bruxelles et l'Université de Yale
• Accès à des cours du CHUV et de l'Université de Lausanne.

Devenir employé du célèbre Centre hospitalier universitaire du canton de Vaud est une garantie de

• Premiers avantages sociaux tels qu'un congé de paternité de 20 jours et un congé de maternité de 4 mois (il est également possible d'obtenir un congé d'allaitement complémentaire d'un mois)
• Progression salariale régulière adaptée à vos responsabilités
• 25 jours de vacances par an
• Droit à au moins trois jours de formation par an, en accédant à une large offre de cours non seulement du Centre de formation du CHUV mais aussi de prestataires externes
• Possibilité d'accéder à l'un des 500 appartements meublés proposés dans les quartiers environnants en cas de relocalisation en Suisse
• Réductions proposées sur des événements sociaux et culturels, des goodies et d'autres services, grâce à l'association « H-Oxygène »
• Inscription à notre Plan de mobilité et bénéficier de différents avantages (réductions sur les transports publics, promotion de la flotte de voitures « Mobilité » et réductions sur les vélos électriques)
• Possibilité de profiter de nos restaurants d'entreprise de haute qualité, situés dans chaque bâtiment hospitalier, avec une réduction pour les employés.

Contact et envoi de candidature

Personne à contacter en cas de questions concernant ce rôle : Professeur Oliver Y. Chén, Responsable d'unité, Bioinformaticien, téléphone 021 314 16 11

Toutes nos candidatures sont traitées électroniquement. Pour cette raison, nous vous prions de postuler exclusivement en cliquant sur le bouton POSTULER en bas de l'annonce.

Si vous rencontrez des problèmes avec votre candidature, vous pouvez consulter notre document « comment postuler en ligne ». En cas de problèmes techniques, vous pouvez contacter notre équipe de recrutement qui vous aidera (e.recrutement@chuv.ch / +41 21 314 85 70)

Le CHUV applique les exigences de qualité les plus élevées dans le cadre de son processus de recrutement. De plus, soucieux de promouvoir la diversité et l'inclusion sur le lieu de travail, nous nous efforçons d'assurer un traitement égal et d'éviter toute discrimination. Nous sommes impatients de recevoir votre candidature.

Nous tenons à informer les agences de recrutement externes que toute candidature insérée directement sur notre plateforme de recrutement ne sera pas acceptée et ne pourra pas être facturée. Merci de votre compréhension.