Chercheur postdoctoral en protéomique computationnelle et bioinformatique pour les maladies métaboliques

Introduction

L'Université de Lausanne (UNIL) est une institution publique de premier plan en matière d'enseignement supérieur et de recherche en Suisse. Elle est composée de sept facultés pour un total d'environ 17'000 étudiants et emploie environ 5'000 chercheurs, enseignants et personnel technique. Les sciences de la vie et la médecine constituent l'un de ses trois axes principaux de recherche, avec les sciences sociales et environnementales. Le laboratoire d'accueil fait partie du Département des sciences biomédicales (DBS) au sein de la Faculté de biologie et de médecine (FBM) à l'UNIL. Il bénéficie d'une proximité étroite avec l'Hôpital universitaire de Lausanne (CHUV), régulièrement classé parmi les 10 meilleurs centres médicaux universitaires au monde, favorisant un environnement de recherche biomédicale riche et collaboratif.

Présentation

Un poste de chercheur postdoctoral est disponible dans le laboratoire du Prof. Yibo Wu au Département des sciences biomédicales (DBS), Faculté de biologie et de médecine (FBM), Université de Lausanne (UNIL). Notre recherche se concentre sur l'élucidation des mécanismes moléculaires de l'inflammation du tissu adipeux et son rôle crucial dans l'obésité et les complications métaboliques. 
Nous utilisons des approches de biologie des systèmes, intégrant des protéomiques avancées, de la bioinformatique et des analyses multi-omiques pour découvrir les mécanismes fondamentaux qui régissent la santé métabolique humaine. Nous recherchons un chercheur postdoctoral hautement motivé et qualifié, expert en analyse de données protéomiques et en bioinformatique, pour diriger des projets innovants et interdisciplinaires dans un domaine en évolution rapide et cliniquement pertinent.

Informations sur le poste

Date de début prévue : 01.10.2025 ou sur accord
Durée du contrat : contrat d'un an avec possibilité de renouvellement
Pourcentage d'activité : 100% 
Lieu : Lausanne, UNIL-DSB - Bugnon

Vos responsabilités

Le chercheur postdoctoral devra :
    •    Diriger l'analyse computationnelle et statistique de jeux de données protéomiques complexes (DDA, DIA, sans étiquette, TMT) dérivés de modèles murins et de cohortes cliniques humaines.
    •    Développer et optimiser des pipelines de bioinformatique robustes pour le contrôle de la qualité des données, la normalisation, l'imputation des valeurs manquantes et l'analyse de l'expression différentielle des protéines.
    •    Effectuer une interprétation biologique avancée, y compris mais sans s'y limiter à l'analyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA), l'analyse de voies (par exemple, KEGG, Reactome, GO, Ingenuity Pathway Analysis) et l'analyse des réseaux d'interaction protéine-protéine pertinents pour le métabolisme et l'inflammation.
    •    Contribuer à la conception d'expériences omiques, en travaillant en étroite collaboration avec l'équipe de laboratoire humide et la plateforme centrale pour garantir une conception d'étude optimale et des stratégies d'acquisition de données.
    •    Intégrer les données protéomiques avec d'autres ensembles de données omiques (par exemple, génétique, transcriptomique, métabolomique) pour une compréhension systémique des maladies métaboliques humaines.
    •    Jouer un rôle clé dans la préparation de manuscrits, de demandes de subvention et de la présentation des résultats de recherche lors de conférences.
    •    Participer à la formation et au mentorat des étudiants diplômés.

Vos qualifications

Exigences :
    •    Doctorat en protéomique computationnelle, bioinformatique, biologie des systèmes, biochimie ou domaine connexe avec un fort accent sur l'analyse de données protéomiques basées sur la spectrométrie de masse.
    •    Maîtrise de R et/ou Python pour l'analyse statistique, la manipulation des données et la visualisation.
    •    Expérience approfondie avec des logiciels de protéomique courants (par exemple, Proteome Discoverer, Spectronaut, MaxQuant, FragPipe, Perseus) et des outils de bioinformatique pour l'analyse de voies/réseaux.
    •    Bonne compréhension des méthodes statistiques pour les ensembles de données omiques à grande échelle.
    •    Solides compétences en résolution de problèmes et capacité à travailler de manière autonome sur des projets computationnels complexes.
    •    Excellentes compétences en communication et en collaboration.
Souhaitable :
    •    Familiarité avec le métabolisme, l'obésité et les maladies métaboliques 
    •    Expérience avec des données cliniques et l'intégration de données multi-omiques (par exemple, transcriptomique, métabolomique) 
    •    Expérience avec des omiques unicellulaires (par exemple, scRNA-seq)

Ce que le poste vous offre

Vous rejoindrez un groupe de recherche en pleine croissance dédié à la compréhension de l'obésité et des maladies métaboliques grâce à des protéomiques de pointe et à la biologie à niveau systémique. Vous serez à l'avant-garde de la recherche innovante, dirigeant des projets qui combinent des techniques avancées pour décoder les mécanismes moléculaires impactant la santé humaine. 
Le groupe s'engage à votre croissance académique et professionnelle, offrant un environnement de recherche dynamique et de soutien. Vous aurez accès à des équipements de spectrométrie de masse à la pointe de la technologie et à d'autres outils expérimentaux, ainsi qu'à un mentorat d'experts de différentes disciplines. Il y aura de nombreuses occasions de présenter votre travail lors de conférences prestigieuses et de publier dans des revues à fort impact.
Au-delà des avantages scientifiques, vous prospérerez dans un environnement de recherche stimulant et interdisciplinaire avec accès à des installations centrales de classe mondiale et des conditions d'emploi attrayantes en Suisse. Le poste est situé sur le campus médical UNIL/CHUV à Lausanne, près de l'EPFL, offrant une atmosphère intellectuellement stimulante à quelques minutes du lac Léman et des Alpes suisses.

Contact pour plus d'informations

Prof. Yibo Wu
yibo.wu@unil.ch

Votre candidature

Date limite : 31.08.2025

Pour postuler, veuillez soumettre votre candidature complète (y compris CV, une lettre de motivation détaillant votre expérience et vos intérêts de recherche, liste des publications et coordonnées de trois références) 
La révision des candidatures commencera le 1er août 2025 et se poursuivra jusqu'à ce que le poste soit pourvu. Seules les candidatures soumises par le biais du site Web spécifié seront prises en compte.

Veuillez envoyer votre candidature complète en Word ou PDF.
Seules les candidatures via ce site Web seront prises en compte.

Nous vous remercions de votre compréhension.

Informations supplémentaires

UNIL s'engage à :
•    l'égalité, la diversité et l'inclusion au sein de sa communauté ;
•    garantir un environnement ouvert et respectueux propice au développement personnel ;
•    offrir des conditions de travail qui facilitent l'équilibre entre vie professionnelle et vie privée ;
•    soutenir les chercheurs en début de carrière.

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